Дипломные работы, выполненные на базе Лаборатории:

  • Акимов Д.В., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Компьютерный поиск ингибиторов интегразы ВИЧ-1».
  • Александров К.Е., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Информационный ресурс по функциональному картированию белков вируса гепатита С».
  • Беженцев В.М. ФКН НИУ Высшая школа экономики. «Поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1 методами структурной биоинформатики».
  • Веселова Д.А. МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Анализ трёхмерных паттернов ферментативной специфичности фосфорилирования белков с использованием разработанного программного средства».
  • Дмитриев А.В., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Компьютерный прогноз биотрансформаций химических соединений, осуществляемых изоформой 3А4 цитохрома Р 450».
  • Дружиловский Д.С., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Компьютерное прогнозирование ингибиторов интегразы ВИЧ-1».
  • Захаров А.В., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Количественный анализ взаимосвязей «структура-активность» ингибиторов циклин-зависимой киназы 1».
  • Карасев Д.А., РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Анализ аминокислотных последовательностей, обуславливающих специфичность белков-субстратов к протеинкиназам семейств MAPK и CDK».
  • Коборова О.Н., Факультет Биоинформатики и Биоинженерии МГУ. «Разработка и реализация метода оценки противоопухолевых мишеней для терапии рака молочной железы».
  • Конова В.И., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Поиск перспективных фармакологических мишеней для терапии болезни Альцгеймера».
  • Иванов С.М., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Компьютерный поиск молекулярных мишеней, связанных с побочными эффектами нестероидных противовоспалительных препаратов».
  • Лагунин А.А., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Экспертная система по взаимосвязям фармакологических эффектов и механизмов действия биологически активных соединений».
  • Левченко М.Е., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Рецепторы возбуждающих аминокислот: компьютерный поиск новых лигандов и анализ механизмов».
  • Мартынова Н.Б., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Создание компьютерных комбинаторных библиотек олигопептидов и пептидомиметиков для поиска базовых структур новых лекарств».
  • Муртазалиева Х.А. МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Компьютерный поиск и экспериментальная валидация фармакологических веществ, действующих на клеточную линию MDA-MB-231».
  • Погодин П.В., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Компьютерное прогнозирование взаимодействия низкомолекулярных органических соединений с белками-мишенями на основе программы PASS и базы данных ChEMBL».
  • Потапов В.Ю., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «О роли электростатических взаимодействий в формировании белок-белковых комплексов».
  • Садым (Рудик) А.В., МИФИ. «Разработка Интернет-системы прогнозирования спектра биологических активностей».
  • Саулин П.С., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Особенности аминокислотного состава Т-эпитопов».
  • Семин М.И. МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Компьютерный подход к оценке межлекарственных взаимодействий, приводящих к гепатотоксичности».
  • Сергейко А.В., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Расчет химической структуры соединений класса макролидов на основе доменной структуры белкового синтезирующего комплекса».
  • Сереженкина И.В., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Функциональное и антигенное картирование аминокислотных последовательностей структурных белков вирусов семейства Flaviviridae».
  • Фильц О.А., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Компьютерное конструирование веществ с заданными свойствами из библиотек структурных фрагментов»
  • Фоменко А.Е., МБФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Анализ структурно-функциональных соотношений в сериновых протеазах методами биоинформатики».
  • Урусова А.Ф., РНИМУ им. Н.И. Пирогова. «Разработка алгоритма выбора данных для построения моделей количественного анализа взаимосвязи «структура-активность» на примере обратной транскриптазы ВИЧ».

Диссертационные работы, выполненные на базе Лаборатории:

  • Акимов Д.В. «Компьютерный поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1». Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.00.04. – «биохимия».
  • Бородина Ю.В. «Компьютерный анализ сходства фармакологических веществ с эндогенными биорегуляторами рецепторного действия и их синтетическими аналогами». Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.00.04. – «биохимия».
  • Дмитриев А.В. «Компьютерный прогноз взаимодействия ксенобиотиков с цитохромами Р450 человека». Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.00.28. – «биоинформатика».
  • Дружиловский Д.С. «Поиск и оптимизация новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1 на основе компьютерного прогноза», Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.01.09 – «математическая биология, биоинформатика».
  • Дубовская (Конова) В.И., «Компьютерный поиск веществ, обладающих цитотоксичностью по отношению к клеточным линиям рака молочной железы», Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.01.09 – «математическая биология, биоинформатика».
  • Захаров А.В. «Прогноз количественных свойств органических соединений на основе дескрипторов атомных окрестностей». Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.00.28. – «биоинформатика».
  • Еремеевская (Коборова) О.Н. «Поиск фармакологических мишеней для терапии рака молочной железы на основе компьютерного моделирования регуляции клеточного цикла», Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.01.09 – «математическая биология, биоинформатика».
  • Лагунин А.А. «Поиск новых биологически активных веществ на основе компьютерного анализа взаимосвязей структура-механизм-эффект». Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.00.04. – «биохимия».
  • Линде Д.М. «Межмолекулярное узнавание в глобулярных белках Брукхейвенского банка данных». Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.00.04. – «биохимия».
  • Ромеро Рейес И.В. «Оценка аффинности комплексов белок-лиганд с применением нейронных сетей», Дис. соиск. уч. ст. канд. физ.-мат наук по специальности 05.13.18 – «математическое моделирование, численные методы и комплексы программ».
  • Рудик А.В. «Компьютерный прогноз биотрансформации ксенобиотиков». Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.00.28. – «биоинформатика».
  • Сергейко А.В. «Компьютерное конструирование ферментативных систем, обеспечивающих синтез макролидов с заданными свойствами». Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.00.28. – «биоинформатика».
  • Тарасова (Фильц) О.А. «Конструирование веществ с заданной биологической активностью на основе комбинирования функционально-значимых фрагментов», Дис. соиск. уч. ст. канд. биол. наук по специальности 03.01.09 –«математическая биология, биоинформатика».

Докторские диссертации, подготовленные на базе Лаборатории:

  • Лагунин А.А. «Компьютерная оценка плейотропного действия фармакологических веществ». Дис. соиск. уч. ст. докт. биол. наук по специальности 03.01.09. – «математическая биология, биоинформатика».