Российский журнал

ISSN 0042-8809

Главное меню  ׀  Редакционная коллегия ׀  Международный редакционный совет  ׀  Основные направления ׀   Содержания и рефераты  ׀  Правила для авторов ׀  Подписка

Выпуск: Том 55, Выпуск 3

Название: ПРЕДСКАЗАНИЕ ВЗАИМОСВЯЗАННЫХ БЕЛКОВ МЕТОДАМИ СРАВНИТЕЛЬНОЙ ГЕНОМИКИ IN SILICO

Авторы: М.А. Пятницкий*, А.В. Лисица, А.И. Арчаков

Адрес:

НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН, 119121, Москва, Погодинская ул. д.10; эл. почта: mpyat@bioinformatics.ru

Реферат:

     Обзор посвящен компьютерному поиску взаимосвязанных белков методами сравнительной геномики. Возрастающие возможности биотехнологий по секвенированию новых геномов привели к накоплению данных о последовательностях миллионов генов. Функции большинства этих генов неизвестны, и только для малой части кодируемых ими белков функция может быть определена в эксперименте. Возникает потребность в надежных и достоверных алгоритмах предсказания функций (аннотации) белков методами in silico. В обзоре описаны основные подходы сравнительной геномики, использующие как традиционный способ переноса функций на основании гомологии последовательностей, так и с использованием контекстных свойств генов (методы филогенетических профилей и метод генов-соседей). Применение современных методов сравнительной геномики позволяет получить корректные функциональные аннотации для более чем половины всех белков протеома.

Ключевые слова: взаимосвязанные белки, белок-белковые взаимодействия, функциональная аннотация, филогенетические профили, сравнительная геномика.

Биомедицинская химия, 2009 том 55, вып. 3, с. 230-246.

[Back]