Российский журнал

ISSN 0042-8809

Главное меню  ׀  Редакционная коллегия ׀  Международный редакционный совет  ׀  Основные направления ׀   Содержания и рефераты  ׀  Правила для авторов ׀  Подписка

Выпуск: Том 56, Выпуск 3

Название: СРАВНИТЕЛЬНЫЙ ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ТРОМБИНА С АНТИТРОМБИНОВЫМИ АПТАМЕРАМИ И ИХ ГЕТЕРОДИМЕРНОЙ КОНСТРУКЦИЕЙ

Авторы: С.Ю. Рахметова, С.П. Радько*, О.В. Гнеденко, Н.В. Бодоев, А.С. Иванов, А.И. Арчаков

Учреждение Российской академии медицинских наук научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН, 119121 Москва, ул. Погодинская, 10; тел.: (499) 246-71-15; факс: (499) 245-08-57; эл. почта: radko@ibmc.msk.ru

Реферат:

        Аптамеры, селективно взаимодействующие с анион-связывающими экзосайтами 1 и 2 тромбина, объединяли в димерные олигонуклеотидные конструкции с помощью поли-(dT)-линкера длиной 35 нуклеотидов. Образование комплексов тромбина с аптамерами и их гетеро- и гомодимерными конструкциями измеряли на оптическом биосенсоре Biacore-3000. Значения K_D, полученные для гетеро- и гомодимерных конструкций были соответственно в 25-30 раз и 2-3 раза ниже значений KD для исходных аптамеров. Анализ температурных зависимостей K_D в интервале 10°С–40°С показал, что аффинность увеличивается с понижением температуры. При этом изменение энтальпии DH при образовании комплексов тромбина с аптамерами и гетеродимерной конструкцией было практически одинаково. Значение изменения энтропии DS при образовании комплекса тромбина с гетеродимерной конструкцией было в 1,5-2 раза выше, чем значение DS для комплексов с аптамерами. При возрастании температуры с 10°С до 37°С скорости как образования, так и распада комплексов увеличивались. При этом скорость диссоциации комплекса тромбин с гетеродимерной конструкцией была заметно ниже, чем для комплексов с аптамерами, при обеих температурах.

Ключевые слова: аптамеры, тромбин, гетеродимерная конструкция, аффинность, термодинамика.

Биомедицинская химия, 2010 том 56, вып. 3, с. 404-411.

[Back]