Лаборатория анализа постгеномных данных

О лаборатории
Сотрудники
Разработки
Публикации
Партнеры
Статистика научной деятельности

Другие лаборатории


О ЛАБОРАТОРИИ

Лаборатория создана в 2011 году.
Зав. лабораторией – к.б.н. Пономаренко Елена Александровна,
                                (тел. +7 (499) 245-27-53, e-mail: Этот e-mail адрес защищен от спам-ботов, для его просмотра у Вас должен быть включен Javascript )
Штат лаборатории – 7 сотрудников
Расположение – ИБМХ, корпус 1, этаж 2, комната 205

Технологические достижения последних лет позволяют получать данные о сотнях транскриптах или белках в ходе одного эксперимента. Накопление таких данных и открытый доступ к ним создает хорошие предпосылки для развития мета-анализа и получения новых знаний без постановки эксперимента, при этом с каждым годом все сложнее аннотировать полученные экспериментальные результаты без использования автоматизированных подходов.

Лаборатория анализа постгеномных данных специализируется на разработке Веб-ориентированных программных продуктов, предназначенных для анализа и аннотации результатов транскриптомных или протеомных экспериментов.

Результатом анализа может быть отображение набора идентификаторов генов или белков, выявленных в ходе эксперимента, на опубликованные данные. Это позволяет сопоставить результаты широкомасштабных экспериментов с текущим уровнем знаний, отраженном в рефератах рецензируемых научных статей. Картирование на профиль индивидуальной активности пользователя позволяет получить персонифицированную информацию о нестандартных взаимосвязях между исследуемыми биологическими объектами и оптимизировать научный поиск.

Тел.: +7 (499) 245-27-53


Основные направления работ
Основная тематика лаборатории – информационное сопровождение российской части проекта «Протеом человека»:
  • Прогнозирование и аннотирование взаимодействующих белков на основе масштабного анализа результатов масс-спектрометрических экспериментов, анализа геномных данных и автоматического анализа опубликованных данных.
  • Разработка системы менеджмента контента и системы учета и регистрации экспериментальных данных, полученных в ходе выполнения проекта «Протеом человека».
  • Создание аналитической системы на основе алгоритма обработки обращений к молекулярно-биологическим информационным ресурсам (ГК №903 от 26.05.2010).