|
Дата и время проведения: 30 ноября 2011 года, 16:00 Место проведения: Институт биомедицинской химии РАМН, Погодинская ул., 10, корп.1, 2-й этаж, конференц-зал ФИО докладчика: Нина Юрьевна Опарина Организация: ИМБ РАН Тема семинара: Веб-платформа Galaxy: применение для решения задач протеомики и исследования белок-кодирующих генов человека Краткое описание: Современные методы геномики, транскриптомики и протеомики позволяют исследователям получать масштабные данные. Благодаря многолетним молекулярно-биологическим и биомедицинским исследования человека на сегодняшний день определена нуклеотидная последовательность эухроматической части генома; исследован популяционный полиморфизм в белок-кодирующих генах и межгенных областях; определен спектр экспрессируемых мРНК в различных тканях в норме и патологии; идентифицированы белки, содержащиеся в ряде тканей и клеток. Объем накопленных данных постоянно увеличивается, что сделало актуальным разработку удобных платформ для их интегрального биоинформатического анализа. Среди наиболее активно развивающихся ресурсов отметим веб-платформу Galaxy, позволяющую экспериментаторам использовать многочисленные средства для анализа генов/геномов, их функций и сопутствующей информации. Платформа может с легкостью быть дополнена необходимыми в рамках конкретной тематики программами. Будут показаны основные сценарии применения Galaxy на примере следующих задач:
|