| Научный доклад "База знаний как инструмент для проведения медико-биологических исследований с применением постгеномных технологий" |
|
Дата и время проведения: 16 февраля 2010 года, 14:00 Место проведения: Москва, ул. Солянка, 14, комн.17 (зал заседаний Презилиума РАМН) Докладчик: Лисица Андрей Валерьевич, д.б.н., зав.лабораторией биоинформационных технологий ИБМХ РАМН Справка: Молекулярные исследования в медико-биологических науках выходят на качественно новый, постгеномный уровень. Высокая динамика накопления постгеномных экспериментальных данных требует адекватных средств для их компьютерной обработки. Эффективным средством для информационно-аналитической обработки результатов постгеномных экспериментов являются базы знаний. Согласно используемому А.В. Лисицей подходу принципиальное отличие баз знаний от применяющихся в настоящее время баз данных состоит в следующем. В базе данных между хранимыми объектами устанавливаются фиксированные взаимосвязи в рамках жестко заданной информационной модели. В дополнение к фиксированным связям в базе знаний допускаются ситуационные ассоциации, допускающие гибкое адаптирование системы к особенностям решаемой исследовательской задачи. Адаптивные связи являются приемлемой моделью отображения протеома, характеризующегося ситуационной изменчивостью. В связи с этим, базу знаний целесообразно использовать как средство информационно-аналитического обеспечения работ по проекту «Протеом человека». В лаборатории биоинформационных технологий ИБМХ РАМН под руководством А.В. Лисицы исследуются способы применения баз знаний в области молекулярной медицины. Исследования выполняются в сотрудничестве с рядом ведущих научных организаций РАН и кафедрами профильных ВУЗов. Разработаны методики использования баз знаний для решения широкого круга аналитических задач, в том числе, связанных с классификацией молекулярных эффекторов, выявлением фармакологических свойств, исследованием метаболических путей и патогенетических механизмов. На основе современных программных платформ (Neosemantic Framework, Collexis Fingerprint) разработаны средства автоматического формирования баз знаний по результатам постгеномных биомедицинских исследований. |