- Разработки института
- Информационные системы
- Программное обеспечение
- Центр постгеномных технологий
- Терапевтический мониторинг
Исследование фундаментальных основ жизнедеятельности, включая онтогенез, в норме и патологии.
- Выявлены особенности первичной структуры белков мозга мышей и крыс, определяющие связывание с изатином. Выявлены изменения в профиле изатин-связывающих белков мозга мышей при индуцированном паркинсонизме.
- Установлено (in vitro), что фибронектин-специфические интегрины способны стимулировать пролиферацию раковых клеток молочной железы и повышать их устойчивость к химиотерапевтическому действию доксорубицина.
Молекулярная медицина. Медицинские клеточные технологии. Геномика, протеомика, постгеномные технологии. - Получены транскрипционные, протеомные и метаболомные профили линейных клеток крови человека (HL-60) на разных стадиях дифференцировки. С целью системного моделирования этого процесса, определены гены и их продукты, участвующие в клеточной дифференцировке.
- Проведена экспериментально-теоретическая оценка общего количества белков в составе полного протеома человека. Получено, что при уровне концентрации 10-24 М количество различных видов белков в составе протеома теоретически превышает 2 млн. изоформ.
- Показана возможность использования метаболических профилей плазмы крови в качестве дифференциальных маркеров рака предстательной железы. Метаболические профили регистрировали с применением хромато-масс-спектрометрии.
- Разработаны протоколы мультиплексного анализа белков-маркеров инфаркта миокарда в плазме крови пациентов посредством многоканального оптического или электрохимического биосенсора. При детектировании кардиотропонинов достигнут уровень концентрационной чувствительности 10-11 М.
- Открыты новые эпитопы в консервативных участках оболочечных белков вируса гепатита С (ВГС), потенциально пригодные для конструирования прототипов вакцин.
Фармакологическая коррекция процессов жизнедеятельности. Разработка новых лекарственных средств.- Разработаны две лекарственные композиции на основе фосфолипидной транспортной системы — «индолип» с индометацином в качестве действующего вещества и «доксолип» с доксорубицином. Проведен выпуск опытных партий этих препаратов. Полученные лекарственные формы обладают меньшей токсичностью по сравнению со свободными аналогами и проявляют более выраженную специфическую активность.
- Проведены исследования in vitro распределения пяти лекарственных препаратов (доксорубицин, хлорин е6, диклофенак, индометацин, липоевая кислота) по фракциям крови.
- Разработаны тест-системы для контроля содержания противоопухолевого лекарственного фермента аспарагиназы E. carotovora в штаммах-продуцентах E. coli.
- Синтезированы оксистерины, содержащие конформационно жесткой боковой цепью и с полярными заместителями, и способные ингибировать молекулярные пути передачи сигналов (SHH-сигналинг).
- В сети Интернет предоставлен доступ к Веб-сервису, позволяющему алгоритмически прогнозировать токсичность химических соединений на основе их структурной формулы.
Нанобиотехнологии и наноматериалы - Получены чипы для атомно-силовой микроскопии, модифицированные антителами к частицам вирусов гепатита В и С. Данные по регистрации вирусных...Далее
| Информационная система PROTEY: | Информационная система Protey предназначена для хранения, систематизации, обобщения и анализа данных протеомных исследований в максимально подробном представлении. При разработке системы акцент был сделан на создании полностью гибкой системы, подходящей для протеомных исследований любой структуры. Такая гибкость обеспечивается объектно-ориентированной архитектурой системы, а также возможностью системы дополняться извне программами-обработчиками, необходимыми для работы с данными практически любого типа(текст, изображения и т.д.) |
| Информационная система по лекарственным препаратам: | База данных, содержащая информацию о наименованиях (МНН) и структурных формулах около 900 субстанций лекарственных преператов, разрешенных к медицинскому применению в Российской Федерации. |
За период 2000-2007 год в Институте было разработано более 10 программных продуктов. Часть из них переставала развиваться, не выдержав конкуренции с другими академическими аналогами, другие же – лицензировались и успешно конкурировали в коммерческом секторе. Ниже приведены описания трех разработок, которые отражают основные тенденции развития биоинформационных технологий в Институте:
| PASS – программа для предсказания спектра биологической активности | Программа основана на предположении о ведущей роли химической структуры вещества в определении характера его воздействия на организм. Прежде всего, интерес представляют дополнительные лекарственные свойства препаратов, уже используемых в терапевтической практике. Кроме того, программа может использоваться для оценки вероятных побочных эффектов прототипов новых лекарств.
|
| PDP – Postgenomic Data Projector – Разметчик постгеномных данных | Веб-ориентированный программный продукт, предназначенный для отображения набора идентификаторов генов или белков, выявленных в ходе эксперимента по транскриптомному или протеомному профилированию, на опубликованные данные, представленные в виде резюме. |
| ИБМХ-Ресурс\Реактив | Система автоматизации контроля эксплуатации приборного парка (Ресурс) и расходования материальных запасов (Реактив) в ходе выполнения научно-исследовательских работ. В дополнение к продуктам компании «1С» позволяет отслеживать эффективность использования приборов, собирать данные об отказах и ремонтах, планировать мероприятия по техническому обслуживанию и хранить детализированную информацию о составе единицы инвентарного учета.
|
Web-сайт: http://ckp.ibmh.msk.su/ Центр коллективного пользования «Центр постгеномных технологий» был создан в 2003 г. в рамках межведомственной Программы «Протеомика для медицины и биотехнологии». Центр объединил материально-технический и научно-методический потенциал ведущих лидеров отечественной биомедицины и биотехнологии. Интенсивно расширяющаяся приборная база позволяет в настоящее время предоставлять полный спектр высокоэффективных анализов в области геномики, транскриптомики, протеомики и метаболомики. Услуги предоставляются на прейскурантной основе, а также в рамках совместных исследовательских проектов. Приоритеты в обслуживании отдаются организациям – исполнителям государственных заказов или грантов отечественных фондов.
Назначение
В 2001 г в ИБМХ РАМН начал работать Отдел протеомных исследований. Лаборатории отдела были оборудованы новейшими и на тот момент уникальными для России измерительными приборами. Прежде всего это касается масс-спектрометров с источниками ионизации мягкого типа. Учитывая, что регистрация масс-спектров необходима большому числу российских научных коллективов, с самого начала работы у ОПИ сложились тестные научные контакты с институтами РАМН, РАН и отрослевыми НИИ.
С целью упрощения порядка совместной работы и создания ее юридической основы в 2003 году на базе отдела был образован ЦКП "Центр Постгеномных Технологий". В июне 2003 г. Положение о ЦКП было утверждено Ученым Советом ИБМХ РАМН.
Порядок работы
Общие положения - ЦКП "Центр постгеномный технологий" (далее - ЦКП) обеспечивает выполнение заказов российских научно-исследовательских коллективов, выполняющих работы по государственным программам и грантам (далее - клиенты ЦКП).
- Услуги ЦКП оплачиваются на основании утвержденного прейскуранта.
- Перечень услуг коллективного пользования и расценки на них формируются с учетом масштабов государственной поддержки содержания ЦКП и текущих приоритетов федеральных целевых научно-технических программ.
- ЦКП предоставляет услуги в объеме процедур, сертифицированных изготовителями дорогостоящего измерительного оборудования и роботизированных технологических линий.
Порядок заключения договоров с организациями - потребителями услуг коллективного пользования
1. Организация - заказчик услуг заключает договор с ИБМХ РАМН на выполнение работ в рамках ЦКП. Заказчик производит оплату по счету, соcтавленному исходя из объема необходимых ему услуг.
Порядок работы с физическими лицами - потребителями услуг коллективного пользования
1. Физическое лицо также может воспользоваться услугами ЦКП. В этом случае заказчик услуг оплачивает услуги путем перечисления средств на... Далее
«Все есть яд и все лекарство, разница лишь в дозе» | Парацельс |
 “Каждое лекарство яд, а каждый яд в малых дозах может быть лекарством” – истина известная врачам издавна. Подобный дуализм в проявлении лекарствами своих свойств ведет к тому, что лечение зачастую наносит серьезный вред здоровью больного. Чтобы избежать нежелательных последствий лечения, для каждого лекарства устанавливают допустимые дозы, при которых оно проявляет в большей степени лечебные свойства, нежели токсические. Однако это не всегда помогает, т.к. процесс распада и выведения из организма лекарств крайне индивидуален. В результате к проявлению терапевтического эффекта или токсичности лекарства имеет отношение скорее уровень лекарства в крови, нежели назначаемая врачом доза. В случае усиленного распада и выведения из организма лекарства, его концентрация в крови не достигает терапевтической дозы, и, как результат, не наблюдается ожидаемого лечебного эффекта. Обратная ситуация возникает в случае накопления лекарства в крови, что приводит к замещению лечебного эффекта токсическим. Индивидуальный подбор дозы лекарства - необходимое условие для качественного лечения больного и гарантией реализации основного этического принципа всех врачей – не навреди. Действенным инструментом реализации такой персонализированной лекарственной терапии является терапевтический лекарственный мониторинг. Терапевтический лекарственный мониторинг (ТЛМ) основан на определении концентрации лекарственного вещества и его метаболитов в плазме крови или других биологических жидкостях организма. Его проводят для контроля за проводимой лекарственной терапией с тем, чтобы концентрация лекарственного вещества не превысила минимальную токсическую (лекарство не превратилось в яд) и не была ниже минимальной терапевтической (лекарство не перестало лечить). Данные, полученные при ТЛМ, незамедлительно используют для установления индивидуальных особенностей фармакокинетики принимаемых лекарств у данного больного и оптимизации лекарственной терапии.
|