• Исследования института
  • РАМН
  • ФЦП
  • РФФИ
  • Международные проекты
  • Инициативные разработки

В Институте проводятся исследования в рамках фундаментальных тематик Российской академии медицинских наук, государственных контрактов Федеральных целевых программ (ФЦП) Роснауки и Роскосмоса, грантов Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ).


Общая направленность ведущихся в Институте разработок определяется применением высокоэффективных постгеномных и биоинформационных технологий наряду с высокоточными аналитическими методами, основанными на нанотехнологиях.


Ориентированные фундаментальные исследования проводятся в рамках межведомственной программы исследований «Протеомика в медицине и биотехнологии» и направлены на создание принципиально новых диагностических систем в области инфекционных (ВИЧ, гепатиты В и С), онкологических (рак простаты, яичника, печени, механизмы метастазирования) и нейродегенеративных (болезнь Альцгеймера) заболеваний.


На базе Института по заказу Роснауки выполняется комплекс опытно-конструкторских работ по созданию универсальной системы транспорта лекарств в организме. За счет встраивания лекарств, прежде всего противоопухолевых, в состав фосфолипидных наночастиц размером 10-20 нм, существенно может быть повышена их терапевтическая активность и снижены побочные эффекты. Универсальность создаваемой системы позволит в ближайшие 5 лет создать не только более эффективные противоопухолевые лекарства, но и средства для лечения ревматоидного артрита, бронхиальной астмы и заболеваний сердечно-сосудистой системы, а также противовоспалительные и противомикробные препараты


 

Структура выполненных в 2007 году работ

Основание

Количество

Ресурс*

1.Программа «Протеомика в медицине и биотехнолигии» РАМН

5

20%

2. Тематики плана РАМН

14

15%

3. Комплексные проекты ФЦП

1

36%

4. Контракты ФЦП

2

5%

5. Договора соисполнения

4

7%

6. Гранты РФФИ

10

12%

7. Международные гранты и договора

4

8%

8. Инициативная разработка

4

5%


*Процентная доля в годовом бюджете.

В 2005 году Российская академия медицинских наук выделила дополнительное финансирование для поддрежки инновационных разработок в области нанобиотехнологий и компьютерного конструирования лекарств.

Наноустройства для целей медицинской диагностики
Проект направлен на разработку эффективных подходов к диагностике вирусных заболеваний. В работе используются средства атомно-силовой микроскопии и оптические биосенсоры для регистрации отдельных молекулярных комплексов, свидетельсвующих о присутствии в крови пациента вирусных частиц или их антигенов. В ходе работ проектируется регистрирующее устройство на основе стандартного привода для чтения компакт-дисков (CD-ROM).

Эксперименитально-вычислительная платформа "от геномов к лекарству"
Целью проекта является разработка программно-аппаратных средств для реализации полного цикла разработки новых лекарственных соединений. В основе предлагаемого решения лежит концепция выявления в геномах организмов взаимодействующих белков, образующих комплексы. Комплекс рассматривается в качестве молекулярной мишени для прототипов новых лекарств.

Институт принимает активное участие в конкурсах на проведение исследований в рамках Федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы». В 2007 году Научно-исследовательский коллектив Института выполнял работы по 8 государственным контрактам, в пяти из которых ИБМХ РАМН являлся головным исполнителем:

Разработка фосфолипидной транспортной системы и технологии включения в ее состав лекарственных субстанций.
Проект направлен на создание технологии производства более безопасных и эффективных лекарств. Для этого уже применяющееся лекарство встраивают в частицу, состоящую из фосфолипидов.

Конструирование ингибиторов белок-белковых взаимодействий, вовлеченных в развитие инфекционных и соматических заболеваний.
В результате работы получены новые данные о молекулярном механизме развития болезни Альцгеймера. Согласно рабочей гипотезе вызывающий болезнь Альцгеймера процесс олигомеризации бета-амилоида запускается в результате изомеризации этого белка (совместно с ИМБ РАН).

Разработка биосенсорных технологий для анализа специфичности лигандных взаимодействий в ферментных системах, участвующих в метаболизме лекарственных препаратов.
Тематика выполнена коллективом ведущей научной школы академика РАМН А. И. Арчакова. Были исследованы принципы электрохимической регистрации взаимодействия низко-молекулярных веществ с ферментами, метаболизирующими лекарства (цитохромами р450).

Идентификация белковых маркеров колоректального рака, метастазирующего в печень, с использованием комплексного протеомного подхода.
Методики протеомных исследований были применены для создания диагностической тест-системы, позволяющей прогнозировать вероятность рецедива раковой опухоли у прооперированных раковых больных (совместно с РНЦХ РАМН ).

В 2007 году продолжены работы по 11 проектам, поддержанным ранее Российским фондом фундаментальных исследований. Получена поддержка 5-ти проектов, поданных в 2007 году.

В 2007 г. сотрудниками Института подано в РФФИ более 15 проектов от 13 лабораторий. Средний уровень поддержки проектов НИИ БМХ РАМН в рамках РФФИ за 2007 год составил 31 %.

Заявки, подаваемые РФФИ, преимущественно ориентированы на следующие области знаний:

  • Биология и медицинская наука
- Протеомика, структура и функция белков
- Биохимия
- Медицинская химия, фармакология
  • Создание и развитие ИВТР для фундаментальных исследований

Гранты МНТЦ
- «Разработка экспериментально-производственной технологии получения субстанции, создание образцов лекарственной формы, доклинические испытания субстанции, структурно-функциональное изучение и получение модифицированных форм с улучшенными фармакологическими свойствами рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora» .
- «Компьютерный поиск ингибиторов_интегразы ВИЧ-1» .

Гранты ИНТАС
- «Изучение белок-белкового взаимодействия в цитохром P450-содержащих монооксигеназных системах в условиях гидроксилирования» .
- «Построение исчерпывающей модели клеточного цикла млекопитающих в нормальном и патологическом состояниях для предсказания потенциальных противоопухолевых веществ, действующих на ключевые мишени» .

Грант фонда Вэллкома (Wellcome Trust)
- «Протеомный анализ изатин-связывающих белков» .

Договора
- Договор о проведении научно-исследовательских работ (Янссен Фармасевтика) .
- Договор о разработке программного обеспечения для анализа данных времяпролетной масс-спектрометрии (Брукер Дальтоник) .

Методы системной биологии в протеомике
Разрабатывается статистический алгоритм, позволяющий проводит комплексный анализ изображений 2D электрофорегамм. В результате на основе выявленных коррелирующих изменений на уровне экспрессии, рН и мол. массе строится сеть взаимодействующих белков. Методика проходит апробацию на модели диффренцировки стволовых клеток.

Количественные методы протеомного анализа
Возможности матричной и электроспрейной ионизации анализируются в разрезе их применимости для получения количественных характеристик содержания белков в образце. В качестве исходных данных фигурируют интенсивности хроматографических пиков, пиков на масс-хроматограмме, и пиков на масс-спектре MALDI.