- Исследования института
- РАМН
- ФЦП
- РФФИ
- Международные проекты
- Инициативные разработки
В Институте проводятся исследования в рамках фундаментальных тематик Российской академии медицинских наук, государственных контрактов Федеральных целевых программ (ФЦП) Роснауки и Роскосмоса, грантов Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ). Общая направленность ведущихся в Институте разработок определяется применением высокоэффективных постгеномных и биоинформационных технологий наряду с высокоточными аналитическими методами, основанными на нанотехнологиях. Ориентированные фундаментальные исследования проводятся в рамках межведомственной программы исследований «Протеомика в медицине и биотехнологии» и направлены на создание принципиально новых диагностических систем в области инфекционных (ВИЧ, гепатиты В и С), онкологических (рак простаты, яичника, печени, механизмы метастазирования) и нейродегенеративных (болезнь Альцгеймера) заболеваний. На базе Института по заказу Роснауки выполняется комплекс опытно-конструкторских работ по созданию универсальной системы транспорта лекарств в организме. За счет встраивания лекарств, прежде всего противоопухолевых, в состав фосфолипидных наночастиц размером 10-20 нм, существенно может быть повышена их терапевтическая активность и снижены побочные эффекты. Универсальность создаваемой системы позволит в ближайшие 5 лет создать не только более эффективные противоопухолевые лекарства, но и средства для лечения ревматоидного артрита, бронхиальной астмы и заболеваний сердечно-сосудистой системы, а также противовоспалительные и противомикробные препараты | Структура выполненных в 2007 году работ |
Основание | Количество | Ресурс* |
|---|
1.Программа «Протеомика в медицине и биотехнолигии» РАМН | 5 | 20% | 2. Тематики плана РАМН | 14 | 15% | 3. Комплексные проекты ФЦП | 1 | 36% | 4. Контракты ФЦП | 2 | 5% | 5. Договора соисполнения | 4 | 7% | 6. Гранты РФФИ | 10 | 12% | 7. Международные гранты и договора | 4 | 8% | 8. Инициативная разработка | 4 | 5% |
*Процентная доля в годовом бюджете.
В 2005 году Российская академия медицинских наук выделила дополнительное финансирование для поддрежки инновационных разработок в области нанобиотехнологий и компьютерного конструирования лекарств.
| Наноустройства для целей медицинской диагностики | Проект направлен на разработку эффективных подходов к диагностике вирусных заболеваний. В работе используются средства атомно-силовой микроскопии и оптические биосенсоры для регистрации отдельных молекулярных комплексов, свидетельсвующих о присутствии в крови пациента вирусных частиц или их антигенов. В ходе работ проектируется регистрирующее устройство на основе стандартного привода для чтения компакт-дисков (CD-ROM).
|
| Эксперименитально-вычислительная платформа "от геномов к лекарству" | Целью проекта является разработка программно-аппаратных средств для реализации полного цикла разработки новых лекарственных соединений. В основе предлагаемого решения лежит концепция выявления в геномах организмов взаимодействующих белков, образующих комплексы. Комплекс рассматривается в качестве молекулярной мишени для прототипов новых лекарств.
|
Институт принимает активное участие в конкурсах на проведение исследований в рамках Федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы». В 2007 году Научно-исследовательский коллектив Института выполнял работы по 8 государственным контрактам, в пяти из которых ИБМХ РАМН являлся головным исполнителем:
| Разработка фосфолипидной транспортной системы и технологии включения в ее состав лекарственных субстанций. | Проект направлен на создание технологии производства более безопасных и эффективных лекарств. Для этого уже применяющееся лекарство встраивают в частицу, состоящую из фосфолипидов.
|
| Конструирование ингибиторов белок-белковых взаимодействий, вовлеченных в развитие инфекционных и соматических заболеваний. | В результате работы получены новые данные о молекулярном механизме развития болезни Альцгеймера. Согласно рабочей гипотезе вызывающий болезнь Альцгеймера процесс олигомеризации бета-амилоида запускается в результате изомеризации этого белка (совместно с ИМБ РАН). |
| Разработка биосенсорных технологий для анализа специфичности лигандных взаимодействий в ферментных системах, участвующих в метаболизме лекарственных препаратов. | Тематика выполнена коллективом ведущей научной школы академика РАМН А. И. Арчакова. Были исследованы принципы электрохимической регистрации взаимодействия низко-молекулярных веществ с ферментами, метаболизирующими лекарства (цитохромами р450). |
| Идентификация белковых маркеров колоректального рака, метастазирующего в печень, с использованием комплексного протеомного подхода. | Методики протеомных исследований были применены для создания диагностической тест-системы, позволяющей прогнозировать вероятность рецедива раковой опухоли у прооперированных раковых больных (совместно с РНЦХ РАМН ). |
В 2007 году продолжены работы по 11 проектам, поддержанным ранее Российским фондом фундаментальных исследований. Получена поддержка 5-ти проектов, поданных в 2007 году.
В 2007 г. сотрудниками Института подано в РФФИ более 15 проектов от 13 лабораторий. Средний уровень поддержки проектов НИИ БМХ РАМН в рамках РФФИ за 2007 год составил 31 %. Заявки, подаваемые РФФИ, преимущественно ориентированы на следующие области знаний: - Биология и медицинская наука
- Протеомика, структура и функция белков - Биохимия - Медицинская химия, фармакология
- Создание и развитие ИВТР для фундаментальных исследований
| Гранты МНТЦ | - «Разработка экспериментально-производственной технологии получения субстанции, создание образцов лекарственной формы, доклинические испытания субстанции, структурно-функциональное изучение и получение модифицированных форм с улучшенными фармакологическими свойствами рекомбинантной L-аспарагиназы Erwinia carotovora» . - «Компьютерный поиск ингибиторов_интегразы ВИЧ-1» . |
| Гранты ИНТАС | - «Изучение белок-белкового взаимодействия в цитохром P450-содержащих монооксигеназных системах в условиях гидроксилирования» . - «Построение исчерпывающей модели клеточного цикла млекопитающих в нормальном и патологическом состояниях для предсказания потенциальных противоопухолевых веществ, действующих на ключевые мишени» . |
| Грант фонда Вэллкома (Wellcome Trust) | - «Протеомный анализ изатин-связывающих белков» . |
| Договора | - Договор о проведении научно-исследовательских работ (Янссен Фармасевтика) . - Договор о разработке программного обеспечения для анализа данных времяпролетной масс-спектрометрии (Брукер Дальтоник) .
|
| Методы системной биологии в протеомике |
Разрабатывается статистический алгоритм, позволяющий проводит комплексный анализ изображений 2D электрофорегамм. В результате на основе выявленных коррелирующих изменений на уровне экспрессии, рН и мол. массе строится сеть взаимодействующих белков. Методика проходит апробацию на модели диффренцировки стволовых клеток.
|
| Количественные методы протеомного анализа |
Возможности матричной и электроспрейной ионизации анализируются в разрезе их применимости для получения количественных характеристик содержания белков в образце. В качестве исходных данных фигурируют интенсивности хроматографических пиков, пиков на масс-хроматограмме, и пиков на масс-спектре MALDI.
|
|