• Исследование молекулярных механизмов развития социально-значимых заболеваний с применением постгеномных технологий. (лаб. диагностической протеомики)
• Разработка системного подхода к анализу живых объектов путем комбинации методов геномики, ранскриптомики, метаболомики и био- и хемоинформатики с математическими средствами обработки данных в целях выявления молекулярных мишеней действия лекарств. (лаб. системной биологии и структурно-функционального конструирования лекарств)
• Разработка оригинальных алгоритмов и компьютерных программ для установления взаимосвязей «аминокислотная последовательность – структура – функция» и прогнозирования функций новых белков на основе аминокислотных последовательностей. (лаб. биоинформационых технологий )
• Разработка фундаментальных и прикладных проблем нанопатологии. (лаб. нанобиотехнологий)
• Поиск новых молекулярных мишеней фармакологической регуляции патологических процессов при заболеваниях центральной нервной системы и сердеч но-сосудистой системы (лаб. биохимии аминов и циклических нуклеотидов )
• Разработка экспериментально-вычислительных подходов для рационального конструирования лекарств и создания лекарствен ных нанокомпозиций и нанолекарств (лаб. фосфолипидных нанолекарств и транспортных систем)
• Изучение молекулярно-генетических и биохимиических механизмов неопластичес кого превращения и опухолевой прогрессии, новых молекулярных маркеров для диагностики (лаб. биосинтеза аминов)

Темы ИБМХ РАМН в рамках программы РАМН "Нанотехнологии и наноматериалы в медицине на период 2008-2015 гг.":

• Развитие технологий определения сверхнизких концентраций молекул с применением молекулярных детекторов (лаб. нанобиотехнологии)
• Разработка медицинских диагностических систем на основе атомно-силовой микроскопии и нанопроводящих материалов (лаб. нанобиотехнологии)
• Исследование новых лекарственных препаратов, снабженных системой траспорта на основе фосфолипидных наночастиц (лаб. фосфолипидных нанолекарств и транспортных систем)