Федеральное государственное бюджетное научное учреждение
«Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича»

Лаборатория анализа постгеномных данных

Ильгисонис Екатерина Викторовна ЗАВЕДУЮЩАЯ ЛАБОРАТОРИЕЙ
к.б.н.
ResearcherID
Scopus ID
ORCID
eLibraryID
КОНТАКТЫ

(499) 245-27-53

Нарыжный Станислав Николаевич д.б.н. ResearcherID
Scopus ID
ORCID
eLibraryID
Мошковский Сергей Александрович д.б.н., професор РАН ResearcherID
Scopus ID
eLibraryID

Краснов Георгий Сергеевич Scopus ID




Зорина Елена Сергеевна eLibraryID




Тарбеева Светлана Николаевна




Гончаров Антон Олегович




Купцов Никита Сергеевич




Технологические достижения последних лет позволяют получать данные о сотнях транскриптах или белках в ходе одного эксперимента. Накопление таких данных и открытый доступ к ним создает хорошие предпосылки для развития мета-анализа и получения новых знаний без постановки эксперимента, при этом с каждым годом все сложнее аннотировать полученные экспериментальные результаты без использования автоматизированных подходов.

Лаборатория анализа постгеномных данных специализируется на разработке Веб-ориентированных программных продуктов, предназначенных для анализа и аннотации результатов транскриптомных или протеомных экспериментов.

Основная тематика лаборатории – информационное сопровождение российской части проекта «Протеом человека».

avatar none  Нарыжный С.Н., Легина О.К. (2021) Гаптоглобин как биомаркер, Биомедицинская химия, 67(2), 105-118. DOI:10.18097/PBMC20216702105

avatar none  Naryzhny S., Ronzhina N., Zorina E., Kabachenko F., Zavialova M., Zgoda V., Klopov N., Legina O., Pantina R. (2021) Evaluation of Haptoglobin and Its Proteoforms as Glioblastoma Markers, International Journal of Molecular Sciences, 22(12), 6533. DOI:10.3390/ijms22126533

avatar none  Naryzny S.N., Legina O.K. (2021) Haptoglobin as a Biomarker, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 15(3), 184-198. DOI:10.1134/S1990750821030069

avatar none  Krasnov G., Shkrigunov T., Radko S., Ptitsyn K., Shapovalova V., Timoshenko O., Khmeleva S., Kurbatov L., Kiseleva Y., Ilgisonis E., Kiseleva O., Vakhrushev I., Tsvetkova A., Buromski I., Markin S., Archakov A., Lisitsa A., Ponomarenko E. (2021) Human Chr18 transcriptome dataset combined from the Illumina HiSeq, ONT MinION, and qPCR data, Data in Brief, 36, 107130. DOI:10.1016/j.dib.2021.107130

avatar none  Дейниченко К.А., Краснов Г.С., Радько С.П., Птицын К.Г., Шаповалова В.В., Тимошенко О.С., Хмелева С.А., Курбатов Л.К., Киселева Я.Я., Ильгисонис Е.В., Пятницкий М.А., Поверенная Е.В., Киселева О.И., Вахрушев И.В., Цветкова А.В., Буромский И.В., Маркин С.С., Згода В.Г., Арчаков А.И., Лисица А.В., Пономаренко Е.А. (2021) Гены «стахановцы» 18 хромосомы человека, отсутствующие белки и не охарактеризованные белки в ткани печени и клеточной линии HepG2, Biomedical Chemistry: Research and Methods, 4(1), e00144. DOI:10.18097/BMCRM00144

avatar none  Tarbeeva S., Lyamtseva E., Lisitsa A., Kozlova A., Ponomarenko E., Ilgisonis E. (2021) ScanBious: Survey for Obesity Genes Using PubMed Abstracts and DisGeNET, Journal of Personalized Medicine, 11(4), 246. DOI:10.3390/jpm11040246

avatar none  Kiseleva O.I., Arzumanian V.A., Poverennaya E.V., Pyatnitskiy M.A., Ilgisonis E.V., Zgoda V.G., Plotnikova O.A., Sharafetdinov K.K., Lisitsa A.V., Tutelyan V.A., Nikityuk D.B., Archakov A.I., Ponomarenko E.A. (2021) Does Proteomic Mirror Reflect Clinical Characteristics of Obesity?, Personalized Medicine, 11(2), 64. DOI:10.3390/jpm11020064

avatar none  Ilgisonis E.V., Vavilov N., Ponomarenko E., Lisitsa A., Poverennaya E., Zgoda V., Radko S.P., Archakov A. (2021) Genome of the single human chromosome 18 as a "gold standard" for its transcriptome, Frontiers in Genetics, 12, 674534. DOI:10.3389/fgene.2021.674534

avatar none  Шаповалова В.В., Радько С.П., Птицын К.Г., Краснов Г.С., Наход К.В., Конаш О.С., Виноградина М.А., Пономаренко Е.А., Дружиловский Д.С., Лисица А.В. (2020) Обработка длинных чтений транскриптомного секвенирования на облачной вычислительной платформе Amazon Web Services, Biomedical Chemistry: Research and Methods, 3(4), e00131. DOI:10.18097/BMCRM00131

avatar none  Krivosheeva I.A., Filatova A.Y., Moshkovskii S.A., Baranova A.V., Skoblov M.Y. (2020) Analysis of candidate genes expected to be essential for melanoma surviving, Cancer Cell International, 20(1), 488. DOI:10.1186/s12935-020-01584-2