Федеральное государственное бюджетное научное учреждение
«Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича»

Лаборатория анализа постгеномных данных

Ильгисонис Екатерина Викторовна ЗАВЕДУЮЩАЯ ЛАБОРАТОРИЕЙ
к.б.н.
ResearcherID
Scopus ID
ORCID
eLibraryID
КОНТАКТЫ

+7 (499) 245-27-53

Пономаренко Елена Александровна д.б.н. ResearcherID
Scopus ID
ORCID
eLibraryID
Зорина Елена Сергеевна eLibraryID




Тарбеева Светлана Николаевна




Сарыгина Елизавета Викторовна




Технологические достижения последних лет позволяют получать данные о сотнях транскриптах или белках в ходе одного эксперимента. Накопление таких данных и открытый доступ к ним создает хорошие предпосылки для развития мета-анализа и получения новых знаний без постановки эксперимента, при этом с каждым годом все сложнее аннотировать полученные экспериментальные результаты без использования автоматизированных подходов.

Лаборатория анализа постгеномных данных специализируется на разработке Веб-ориентированных программных продуктов, предназначенных для анализа и аннотации результатов транскриптомных или протеомных экспериментов.

Основная тематика лаборатории – информационное сопровождение российской части проекта «Протеом человека».

avatar none  Pleshakova T.O., Ivanov Y.D., Valueva A.A., Shumyantseva V.V., Ilgisonis E.V., Ponomarenko E.A., Lisitsa A.V., Chekhonin V.P., Archakov A.I. (2023) Analysis of Single Biomacromolecules and Viruses: Is It a Myth or Reality?, International Journal of Molecular Sciences, 24(3), 1877. DOI:10.3390/ijms24031877

avatar none  Naryzhny S. (2023) Proteomics and Its Applications in Cancers, International Journal of Molecular Sciences, 24(5), 4457. DOI:10.3390/ijms24054457

avatar none  Barashkova A.S., Smirnov A.N., Zorina E.S., Rogozhin E.A. (2023) Diversity of Cationic Antimicrobial Peptides in Black Cumin (Nigella sativa L.) Seeds, International Journal of Molecular Sciences, 24(9), 8066. DOI:10.3390/ijms24098066

avatar none  Naryzhny S. (2023) Quantitative Aspects of the Human Cell Proteome, International Journal of Molecular Sciences, 24(10), 8524. DOI:10.3390/ijms24108524

avatar none  Sarygina E., Kozlova A., Deinichenko K., Radko S., Ptitsyn K., Khmeleva S., Kurbatov L.K., Spirin P., Prassolov V.S., Ilgisonis E., Lisitsa A., Ponomarenko E. (2023) Principal Component Analysis of Alternative Splicing Profiles Revealed by Long-Read ONT Sequencing in Human Liver Tissue and Hepatocyte-Derived HepG2 and Huh7 Cell Lines, International Journal of Molecular Sciences, 24(21), 15502. DOI:10.3390/ijms242115502

avatar none  Kiseleva O.I., Kurbatov I.Y., Arzumanian V.A., Ilgisonis E.V., Vakhrushev I.V., Lupatov A.Y., Ponomarenko E.A., Poverennaya E.V. (2022) Exploring Dynamic Metabolome of the HepG2 Cell Line: Rise and Fall, Cells, 11(22), 3548. DOI:10.3390/cells11223548

avatar none  Vavilov N.E., Zgoda V.G., Tikhonova O.V., Farafonova T.E., Shushkova N.A., Novikova S.E., Yarygin K.N., Radko S.P., Ilgisonis E.V., Ponomarenko E.A., Lisitsa A.V., Archakov A.I. (2020) Proteomic Analysis of Chr 18 Proteins Using 2D Fractionation, Journal of Proteome Research, 19(12), 4901-4906. DOI:10.1021/acs.jproteome.0c00856

avatar none  Kopylov A.T., Ponomarenko E.A., Ilgisonis E.V., Pyatnitskiy M.A., Lisitsa A.V., Poverennaya E.V., Kiseleva O.I., Farafonova T.E., Tikhonova O.V., Zavialova M.G., Novikova S., Moshkovskii S.A., Radko S.P., Morukov B.V., Grigoriev A.I., Paik Y.K., Salekdeh G.H., Urbani A., Zgoda V.G., Archakov A.I. (2019) 200+ Protein Concentrations in Healthy Human Blood Plasma: Targeted Quantitative SRM SIS Screening of Chromosomes 18, 13, Y and the Mitochondrial Chromosome Encoded Proteome, Journal of Proteome Research, 18(1), 120-129. DOI:10.1021/acs.jproteome.8b00391

avatar none  Radko S.P., Poverennaya E.V., Kurbatov L.K., Ponomarenko E.A., Lisitsa A.V., Archakov A.I. (2019) The "Missing" Proteome: Undetected Proteins, Not-Translated Transcripts, and Untranscribed Genes, Journal of Proteome Research, 18(12), 4273-4276. DOI:10.1021/acs.jproteome.9b00383

avatar none  Archakov A.I., Aseev A.L., Bykov V.A., Grigoriev A.I., Govorun V.M., Ilgisonis E.V., Ivanov Y.D., Ivanov V.T., Kiseleva O.I., Kopylov A.T., Lisitsa A.V., Mazurenko S.N., Makarov A.A., Naryzhny S.N., Pleshakova T.O., Ponomarenko E.A., Poverennaya E.V., Pyatnitskiy M.A., Sagdeev R.Z., Skryabin K.G., Zgoda V.G. (2019) Challenges of the Human Proteome Project: 10-year Experience of the Russian Consortium, Journal of Proteome Research, 18(12), 4206-4214. DOI:10.1021/acs.jproteome.9b00358