Лаборатория структурной биоинформатики
Веселовский Александр Владимирович ЗАВЕДУЮЩИЙ ЛАБОРАТОРИЕЙ
д.б.н. ResearcherID Scopus ID eLibraryID |
КОНТАКТЫ |
|
Таланова Анастасия Владимировна
ResearcherID
Scopus ID eLibraryID |
ОСНОВНЫЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ
Применение методов биоинформатики и трехмерного молекулярного моделирования для предсказания структуры, свойств высоко- и низкомолекулярных соединений и их взаимодействий, поиск новых биологически активных соединений, предсказание токсичности веществ для широкого спектра практических задач, преимущественно биомедицинской направленности.
Kомпьютерное моделирование пространственных структур белков, межмолекулярных комплексов (белок/белок, белок/низкомолекулярный лиганд, белок/нуклеиновые кислоты).
Предсказание аффинности комплексов.
Предсказание ADMET свойств соединений.
Поиск и конструирование ингибиторов ферментов, белок-белковых взаимодействий и др.
Виртуальный скрининг.
Анализ количественной взаимосвязи структура-активность (свойство).
- Участие в межведомственной программы исследований РАМН «Протеомика в медицине и биотехнологии».
- Участие в работах в рамках договора с ЦНИИмаш по ОКР «МКС-Наука-ИБМХ-2007-2009» «Определение белков и ингибиторов. Проведение подготовки космических экспериментов для кристаллизации белков и их комплексов (КЭ «Кристаллизатор»)»
- Development and application of QSAR rodent toxicity models for chemical compounds (грант МНТЦ №3777)
- Азольные ингибиторы CYP51 из M. tuberculosis (грант РФФИ №04-04-48039-а, 2004-2006)
- Analysis of active sites structures of MAO A and B (грант INTAS 99-00433, 2000-2003)
- Функциональное картирование белков вируса гепатита С В рамках проекта «Идентификация перспективных мишеней действия новых лекарственных препаратов на основе реконструкции генных сетей» (Договор № 02.434.11.3004)
- Создание пакета прикладных программ для оценки токсичности химических соединений (Гос. контракт № 02.434.11.1014 совместно с ИФАВ РАН)
- Разработка ингибиторов белок-белковых взаимодействий для инфекционных и соматических заболеваний (гос. контракт 02.512.11.2044)
- Исследование молекулярных механизмов взаимодействия хитин-связывающих доменов белков с природными и модифицированными лигандами и созданиe сорбетов с заданной селективностью для аффинной очистки и иммобилизации рекомбинантных белков (грант РФФИ 07-04-12204 совместно с Центром «Биоинженирии» РАН)
- Ингибирование про- и антипрогестинами роста раковых клеток (грант РФФИ, 2005-2007)
- Computer-aided prediction of chemical ecotoxicity (грант МНТЦ №888, 2005-2008)
- Computer-assisted discovery of new HIV integrase inhibitors (грант МНТЦ №3197р, 2005-2008)
- Предсказание селективности связывания и спектра действия лигандов ядерных рецепторов на основании анализа виртуальных взаимодействий (грант РФФИ, 2008-2009)
Shumyantseva V.V., Koroleva P.I., Bulko T.V., Shkel T.V., Gilep A.A., Veselovsky A.V. (2023) Approaches for increasing the electrocatalitic efficiency of cytochrome P450 3A4, Bioelectrochemistry (Amsterdam, Netherlands), 149, 108277. DOI:10.1016/j.bioelechem.2022.108277
Dumina M., Zhdanov D., Zhgun A., Pokrovskaya M., Aleksandrova S., Veselovsky A., El’darov M. (2023) Enhancing the Catalytic Activity of Thermo-Asparaginase from Thermococcus sibiricus by a Double Mesophilic-like Mutation in the Substrate-Binding Region, International Journal of Molecular Sciences, 24(11), 9632. DOI:10.3390/ijms24119632
Buneeva O., Kopylov A., Gnedenko O., Medvedeva M., Veselovsky A., Ivanov A., Zgoda V., Medvedev A. (2023) Proteomic profiling of mouse brain pyruvate kinase binding proteins: a hint for moonlighting functions of PKM1?, International Journal of Molecular Sciences, 24(8), 7634. DOI:10.3390/ijms24087634
Latysheva A.S., Zolottsev V.A., Veselovsky A.V., Scherbakov K.A., Morozevich G.E., Zhdanov D.D., Novikov R.A., Misharin A.Y. (2023) Oxazolinyl derivatives of androst-16-ene as inhibitors of CYP17A1 activity and prostate carcinoma cells proliferation: Effects of substituents in oxazolinyl moiety, Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, 230, 106280. DOI:10.1016/j.jsbmb.2023.106280
Zernov N., Veselovsky A.V., Poroikov V.V., Melentieva D., Bolshakova A., Popugaeva E. (2022) New Positive TRPC6 Modulator Penetrates Blood–Brain Barrier, Eliminates Synaptic Deficiency and Restores Memory Deficit in 5xFAD Mice, International Journal of Molecular Sciences, 23(21), 13552. DOI:10.3390/ijms232113552
Plyasova A.A., Berrino E., Khan I.I., Veselovsky A.V., Pokrovsky V.S., Angeli A., Ferraroni M., Supuran C.T., Pokrovskaya M.V., Alexandrova S.S., Gladilina Y.A., Sokolov N.N., Hilal A., Carta F., Zhdanov D.D. (2021) Mechanisms of the Antiproliferative and Antitumor Activity of Novel Telomerase–Carbonic Anhydrase Dual-Hybrid Inhibitors, Journal of Medicinal Chemistry, 64(15), 11432-11444. DOI:10.1021/acs.jmedchem.1c00756
Shcherbinin D., Veselovsky A., Rubtsova M., Grigorenko V., Egorov A. (2020) The impact of long-distance mutations on the Ω-loop conformation in TEM type β-lactamases, Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 38(8), 2369-2376. DOI:10.1080/07391102.2019.1634642
Ershov P.V., Veselovsky A.V., Mezentsev Y.V., Yablokov E.O., Kaluzhskiy L.A., Tumilovich A.M., Kavaleuski A.A., Gilep A.A., Moskovkina T.V., Medvedev A.E., Ivanov A.S. (2020) Mechanism of the Affinity-Enhancing Effect of Isatin on Human Ferrochelatase and Adrenodoxin Reductase Complex Formation: Implication for Protein Interactome Regulation, International Journal of Molecular Sciences, 21(20), 7605. DOI:10.3390/ijms21207605
Savosina P., Karasev D., Veselovsky A., Miroshnichenko Yu., Sobolev B. (2020) Functional and structural features of proteins associated with alternative splicing, International Journal of Biological Macromolecules, 147, 513-520. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2019.09.241
Egorov A., Rubtsova M., Grigorenko V., Uporov I., Veselovsky A. (2019) The Role of the omega-Loop in Regulation of the Catalytic Activity of TEM-Type beta -Lactamases, Biomolecules, 9(12), 854. DOI:10.3390/biom9120854