Группа биобанкинга

Николаев Евгений Николаевич д.ф-м.н., член-корреспондент РАН ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID	Лисица Андрей Валерьевич д.б.н., академик РАН ResearcherID Scopus ID eLibraryID	Кайшева Анна Леонидовна к.б.н. ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID
Буткова Татьяна Владимировна ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID	Копылов Артур Тигранович к.б.н. ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID	Изотов Александр Анатольевич ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID
Степанов Александр Александрович ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID	Мальсагова Кристина Ахмедовна к.б.н. ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID	Синицына Александра Александровна ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID
Конаш Оливия Сергеевна

ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ И РАЗРАБОТОК

Организация биорепозитория, с целью получения и анализа данных о молекулярном составе образцов биологического происхождения, их цифровизации и хранения.

Группа биобанкинга входит в состав Национальной ассоциации биобанков и специалистов по биобанкрованию (НАСБИО).

Исследование в области молекулярных основ развития заболеваний, создание молекулярно-генетической регрессионной модели как основы персонализированного прогнозирования онкологических и психических заболеваний. Оценка устойчивости структурных мотивов в глобулярных белках с посттрансляционными модификациями, ассоциированными с развитием онкологических заболеваний. Разработка методов сравнительного иммуноанализа для выявления аллергенов скрытой пищевой непереносимости. Разработка мишеней для потенциального создания тест-систем с целью диагностики онкологических заболеваний.

Cотрудники Группы биобанкинга создали научный и методический задел и разработали методики для:

определения IgG, как в образцах сухой крови (метод dried blood spot), так и в образцах плазмы/сыворотки крови, полученных в стандартных лабораторных условиях, с целью определения пищевой непереносимости;
количественной детекции метаболитов, белков и нуклеиновых кислот в образцах биологического происхождения;
исследования фармакодинамических параметров элиминации лекарственных препаратов в крови (тималин, дипроспан).

ПУБЛИКАЦИИ

Buneeva O.A., Kopylov A.T., Gnedenko O.V., Medvedeva M.V., Kapitsa I.G., Ivanova E.A., Ivanov A.S., Medvedev A.E. (2021) Changes in the Mitochondrial Subproteome of Mouse Brain Rpn13-Binding Proteins Induced by the Neurotoxin MPTP and the Neuroprotector Isatin, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 15(3), 199-214. DOI:10.1134/S1990750821030021

Krasnov G., Shkrigunov T., Radko S., Ptitsyn K., Shapovalova V., Timoshenko O., Khmeleva S., Kurbatov L., Kiseleva Y., Ilgisonis E., Kiseleva O., Vakhrushev I., Tsvetkova A., Buromski I., Markin S., Archakov A., Lisitsa A., Ponomarenko E. (2021) Human Chr18 transcriptome dataset combined from the Illumina HiSeq, ONT MinION, and qPCR data, Data in Brief, 36, 107130. DOI:10.1016/j.dib.2021.107130

Buneeva O., Kopylov A., Kaloshina S., Zgoda V., Medvedev A. (2021) 20S and 26S proteasome-binding proteins of the rabbit brain: A proteomic dataset, Data in Brief, 38, 107276. DOI:10.1016/j.dib.2021.107276

Saburina I.N., Zurina I.M., Kosheleva N.V., Gorkun A.A., Volkova E.N., Grinakovskaya O.S., Rybakov A.S., Kaysheva A.L., Kopylov A.T., Morozov S.G. (2021) MAPK and Notch-Mediated Effects of Meso-Xanthin F199 Compounds on Proliferative Activity and Apoptosis of Human Melanocytes in Three-Dimensional Culture, BioMed Research International, 2021, 8463161. DOI:10.1155/2021/8463161

Shulpekova Yu., Nechaev V., Kardasheva S., Sedova A., Kurbatova A., Bueverova E., Kopylov A., Malsagova K., Dlamini J.C., Ivashkin V. (2021) The Concept of Folic Acid in Health and Disease, Molecules, 26(12), 3731. DOI:10.3390/molecules26123731

Ivanov Y.D., Malsagova K.A., Popov V.P., Kupriyanov I.N., Pleshakova T.O., Galiullin R.A., Ziborov V.S., Dolgoborodov A.Y., Petrov O.F., Miakonkikh A.V., Rudenko K.V., Glukhov A.V., Smirnov A.Y., Usachev D.Y., Gadzhieva O.A., Bashiryan B.A., Shimansky V.N., Enikeev D.V., Potoldykova N.V., Archakov A.I. (2021) Micro-Raman Characterization of Structural Features of High-k Stack Layer of SOI Nanowire Chip, Designed to Detect Circular RNA Associated with the Development of Glioma, Molecules, 26(12), 3715. DOI:10.3390/molecules26123715

Ivanov Y.D., Romanova T.S., Malsagova K.A., Pleshakova T.O., Archakov A.I. (2021) Use of Silicon Nanowire Sensors for Early Cancer Diagnosis, Molecules, 26(12), 3734. DOI:10.3390/molecules26123734

Malsagova K.A., Butkova T.V., Kopylov A.T., Izotov A.A., Rudnev V.R., Klyuchnikov M.S., Stepanov A.A., Kaysheva A.L. (2021) Molecular Portrait of an Athlete, Diagnostics, 11(6), 1095. DOI:10.3390/diagnostics11061095

Rudnev V.R., Kulikova L.I., Kaysheva A.L., Efimov A.V., Tikhonov D. (2021) Use of the Molecular Dynamics Method to Investigate the Stability of α-α-Corner Structural Motifs in Proteins, Symmetry, 13(7), 1193. DOI:10.3390/sym13071193

Kopylov A.T., Petrovsky D.V., Stepanov A.A., Rudnev V.R., Malsagova K.A., Butkova T.V., Zakharova N.V., Kostyuk G.P., Kulikova L.I., Enikeev D.V., Potoldykova N.V., Kulikov D.A., Zulkarnaev A.B., Kaysheva A.L. (2021) Convolutional neural network in proteomics and metabolomics for determination of comorbiity between cancer and schizophrenia, Journal of Biomedical Informatics, 122, 103890. DOI:10.1016/j.jbi.2021.103890

ПАТЕНТЫ

Копылов А.Т., Ильгисонис Е.В., Кайшева А.Л., Мошковский С.А, Филимонов А.Д., Ромашова Ю.А., Згода В.Г., Лисица А.В., Арчаков А.И. Создание основ ультрачувствительной детекции бактериальной ДНК/РНК с использованием электрохимических (био)сенсоров Патент RU2013134985A Способ получения аналитической тест-системы для мультиплексной идентификации и количественного измерения содержания интересующих белков в биологическом образце по содержанию соответствующих им протеотипических маркерных пептидов.

Буткова Т.В. Способ лечения расстройств эрекции и расстройств полового влечения. Патент на изобретение №2483742.

Иванов Ю. Д., Плешакова Т. О. Мальсагова К. А. Козлов А. Ф., Арчаков А. И., Попов В.П. Способ диагностики рака молочной железы и рака яичников. Патент RU2696114C2 от 2019-07-31.