Лаборатория биохимии и химической патологии белков
Лисица Андрей Валерьевич ЗАВЕДУЮЩИЙ ЛАБОРАТОРИЕЙ
д.б.н., академик РАН ResearcherID Scopus ID ORCID eLibraryID |
Тимошенко Ольга Сергеевна ЗАМЕСТИТЕЛЬ ПО ОРГРАБОТЕ
к.б.н. ResearcherID Scopus ID Scopus ID eLibraryID КОНТАКТЫ |
|
|
|
Радько Сергей Павлович к.б.н. ResearcherID
Scopus ID ORCID eLibraryID |
|
Курбатов Леонид Константинович к.б.н. ResearcherID
Scopus ID ORCID eLibraryID |
Птицын Константин Георгиевич к.б.н. ResearcherID
ORCID eLibraryID |
Хмелева Светлана Александровна к.б.н. ResearcherID
Scopus ID ORCID eLibraryID |
НАПРАВЛЕНИЯ
Фундаментальные исследования механизмов биотрансформации лекарств и возможности её модуляции на клеточных линиях гепатоцитарного происхождения с использованием омикс-технологий, биоинформатики и клеточных технологий
Создание диагностических систем для обеспечения биобезопасности в сельском хозяйстве и пищевой промышленности
Анализ влияния ключевых генов сигнального пути эмбриональной дифференцировки (Hh) на экспрессию матриксных металлопротеиназ (ММП) при карциноме шейки матки
Секвенирование транскриптомов клеток человека методом «длинных прочтений» (нанопоровое секвенирование) и адаптирование облачных технологий для анализа данных секвенирования
Лаборатория биохимии и химической патологии белка была создана в 1944 году академиком, проф. В.Н. Ореховичем одновременно с основанием ИБМХ. Проф. Орехович возглавлял лабораторию более 40 лет. С 1988 по 2022 год лабораторию возглавляла проф. Н.И. Соловьева, которая долгие годы была ученицей и коллегой В.Н. Ореховича. Основным направлением исследований лаборатории было изучение структуры и функции протеолитических ферментов и их роли в патогенезе различных заболеваний человека.
В 2023 г. лаборатория была объединена под руководством академика РАН, проф. А.В. Лисицы с двумя другими структурными подразделениями ИБМХ, лабораторией микросомального окисления и группой транскриптомного анализа, сохранив своё название. В настоящее время лаборатория сосредоточена на интеграции омиксных технологий, биоинформатики и клеточных технологий (в сотрудничестве с другими лабораториями ИБМХ) для разработки клеточной модели печени человека с целью изучения механизмов биотрансформации и оценки токсичности лекарственных средств. Также лаборатория развивает подходы к ДНК-диагностике инфекционных заболеваний в формате “по месту необходимости” (point-of-need testing), основанные на изотермической амплификации нуклеиновых кислот и её комбинировании с селективной CRISPR/Cas-детекцией целевых ампликонов.
ПРОЕКТЫ
- Создание новых диагностических систем и обеспечение условий биобезопасности в продовольственной сфере.
- Прикладные разработки по Программе развития генетических технологий для индикации сверхнизких концентраций нуклеотидных последовательностей бактерий и вирусов.
ДОСТИЖЕНИЯ
- Установлены физико-химических свойства, химический состав, структура и обмен белков соединительной ткани, в частности, коллагенов, при различных нормальных физиологических и патологических состояниях. Работы удостоены медали II Международного биохимического конгресса в 1952 г. и медали Биохимического союза Франции в 1955 г. Работы по изучению белков глаза – кристаллинов удостоены медали Пастера в 1957 г.
- Впервые обнаружены, охарактеризованы и внесены в Международную номенклатуру ферментов три тканевые протеиназы: ангиотензин-превращающий фермент (АПФ) – КФ 3.4.15.1 (1970г.); рибосомальная протеиназа, катепсин R – КФ 3.4.99.33 (1975, 1978); пролилэндопептидаза (ПЭП) – КФ 3.4.22.18 (1976; 1979 гг.)
- Обоснована роль цитохромов Р450 в качестве драйверов развития социально-значимых заболеваний (1981-1997гг.)
- Обнаружено новое свойство АПФ – гидролиз связи Arg5-His6 в пептиде бета-амилоиде, главном компоненте сенильных бляшек, накапливающихся в мозге пациентов при болезни Альцгеймера (2008г.)
- Установлена роль матриксных металлопротеиназ (ММП) в качестве ключевых факторов инвазии и метастазирования при плоскоклеточной карциноме шейки матки (1998-2022гг.)
- Проведено транскриптомно-протеомное профилирование клеточных линий и тканей человека в норме и патологии (2006-2015гг.)
Suprun E.V., Khmeleva S.A., Duskaev I.F., Kurbatov L.K., Kuznetsova V.E., Shershov V.E., Chudinov A.V., Radko S.P. (2024) Polymerase incorporation of 4-nitrophenyl modified 2′-deoxyuridine-5′-triphosphates into double-stranded DNA for direct electrochemical detection, Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 241, 115977. DOI:10.1016/j.jpba.2024.115977
Shkrigunov T., Zgoda V., Klimenko P., Kozlova A., Klimenko M., Lisitsa A., Kurtser M., Petushkova N. (2024) The Application of Ejaculate-Based Shotgun Proteomics for Male Infertility Screening, Biomedicines, 12(1), 49. DOI:10.3390/biomedicines12010049
Sarygina E., Kozlova A., Deinichenko K., Radko S., Ptitsyn K., Khmeleva S., Kurbatov L.K., Spirin P., Prassolov V.S., Ilgisonis E., Lisitsa A., Ponomarenko E. (2023) Principal Component Analysis of Alternative Splicing Profiles Revealed by Long-Read ONT Sequencing in Human Liver Tissue and Hepatocyte-Derived HepG2 and Huh7 Cell Lines, International Journal of Molecular Sciences, 24(21), 15502. DOI:10.3390/ijms242115502
Kozlova A., Sarygina E., Deinichenko K., Radko S., Ptitsyn K., Khmeleva S., Kurbatov L., Spirin P., Prassolov V., Ilgisonis E., Lisitsa A., Ponomarenko E. (2023) Comparison of Alternative Splicing Landscapes Revealed by Long-Read Sequencing in Hepatocyte-Derived HepG2 and Huh7 Cultured Cells and Human Liver Tissue, International Journal of Molecular Sciences, 12(12), 1494. DOI:10.3390/biology12121494
Suprun E.V., Khmeleva S.A., Bibik K.V., Ptitsyn K.G., Kurbatov L.K., Radko S.P. (2023) Polymerase incorporation of fluorescein or rhodamine modified 2`-deoxyuridine-5`-triphosphates into double-stranded DNA for direct electrochemical detection, Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 236, 115737. DOI:10.1016/j.jpba.2023.115737
Suprun E.V., Kutdusova G.R., Khmeleva S.A., Ptitsyn K.G., Kurbatov L.K., Radko S.P. (2023) Voltammetric oxidation behavior of single-stranded DNA on carbon screen printed electrodes: From short oligonucleotides to ultralong amplification products, Microchemical Journal, 191, 108800. DOI:10.1016/j.microc.2023.108800
Shkrigunov T., Kisrieva Yu., Samenkova N., Larina O., Zgoda V., Rusanov A., Romashin D., Luzgina N., Karuzina I., Lisitsa A., Petushkova N. (2022) Comparative proteoinformatics revealed the essentials of SDS impact on HaCaT keratinocytes, Scientific Reports, 12(1), 21437. DOI:10.1038/s41598-022-25934-4
Shkrigunov T., Pogodin P., Zgoda V., Larina O., Kisrieva Y., Klimenko M., Latyshkevich O., Klimenko P., Lisitsa A., Petushkova N. (2022) Protocol for Increasing the Sensitivity of MS-Based Protein Detection in Human Chorionic Villi, Current Issues in Molecular Biology, 44(5), 2069-2088. DOI:10.3390/cimb44050140
Solovyeva N.I., Timoshenko O.S., Kugaevskaya E.V., Gureeva T.A. (2021) Interstitial collagenase MMP-1 and EMMPRIN in cell lines and in clinical specimens of cervical squamous cell carcinoma, Molecular Biology Reports, 48(10), 6879-6886. DOI:10.1007/s11033-021-06689-z
Kugaevskaya E.V., Veselovsky A.V., Indeykina M.I., Solovyeva N.I., Zharkova M.S., Popov I.A., Nikolaev E.N., Mantsyzov A.B., Makarov A.A., Kozin S.A. (2018) N-domain of angiotensin-converting enzyme hydrolyzes human and rat amyloid-β(1-16) peptides as arginine specific endopeptidase potentially enhancing risk of Alzheimer’s disease, Scientific Reports, 8, 298. DOI:10.1038/s41598-017-18567-5
- Тюменский государственный университет Минобрнауки России
- Химический факультет MГУ им. M.В. Ломоносова
- Институт биоорганической химии, Минск (Республика Беларусь)
- Комания "Эвалар Мирай Геномикс", Казань
- RU2750816C1 Способ получения рекомбинантной CAS13A-нуклеазы с коллатеральной активностью
- RU2530601C2 Ингибитор образования цинк-зависимых димеров бета-амилоида
- RU2585307C1 Электрохимический способ экспресс-анализа комплексообразования амилоида-бета с ионами металлов
- RU2633078C2Электрохимический способ выявления аминокислотных замен и идентификации пептидов