Федеральное государственное бюджетное научное учреждение
«Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича»

Лаборатория клеточной биологии

Ярыгин Константин Никитич ЗАВЕДУЮЩИЙ ЛАБОРАТОРИЕЙ
д.б.н., член-корреспондент РАН
ResearcherID
Scopus ID
ORCID
eLibraryID
КОНТАКТЫ

(499) 246-84-65

Лупатов Алексей Юрьевич к.б.н. ResearcherID
Scopus ID
eLibraryID

Холоденко Ирина Викторовна к.б.н. ResearcherID
Scopus ID
ORCID
eLibraryID
Вахрушев Игорь Викторович к.м.н. ResearcherID
Scopus ID
eLibraryID

Бурунова Вероника Вячеславовна к.б.н. ResearcherID
Scopus ID
eLibraryID

Гисина Алиса Михайловна к.б.н. ResearcherID
Scopus ID
eLibraryID

Сарыглар Роза Юрьевна ResearcherID
Scopus ID
ORCID
eLibraryID

Ким Ян Сергеевич ResearcherID
Scopus ID



Цветкова Анастасия Валерьевна Scopus ID




Леонов Георгий Евгеньевич




Ярыгина Надежда Константиновна




ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ И РАЗРАБОТОК

ОСНОВНОЕ НАПРАВЛЕНИЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ

Проведение фундаментальных исследований для разработки инновационных клеточных технологий для использования в области регенеративной медицины и онкологии, а также создание клеточных моделей для исследований в области постгеномики.

avatar none Исследуются иммунологические свойства стволовых и прогениторных клеток, включая молекулярные механизмы их взаимодействия с клетками иммунной системы. Изучается участие стволовых и прогениторных клеток в развитии иммунных и воспалительных реакций.

avatar none На моделях ишемического инсульта, лимфэдемы, остеоартроза и других патологий оценивается эффективность и безопасность клеточной терапии и изучаются клеточные и молекулярные механизмы реализации терапевтического действия клеточной терапии. Проводятся исследования в области разработки инновационных клеточных препаратов.

avatar none Разрабатываются подходы к созданию эффективных методов клеточной иммунотерапии онкологических, хронических вирусных и аутоиммунных заболеваний. Подходы включают в себя направленную модификацию клеточных популяций, включая редактирование генома.

avatar none Исследуется клеточная гетерогенность солидных опухолей и, прежде всего, колоректального рака. Особое внимание уделяется изучению молекулярных особенностей популяции раковых стволовых клеток и иммунологическим свойствам клеток опухолевой стромы.

avatar none Разрабатываются подходы к масштабированию методов получения однородных первичных культур клеток, в частности, гепатоцитов.

avatar none Проводятся разносторонние исследования, направленные на изучение свойств мезенхимальных стволовых клеток, а также разработку подходов к их практическому использованию в регенеративной медицине. Последние работы посвящены созданию тканеинженерных аналогов суставого хряща с применением наиболее перспективных технологий трехмерного культивирования клеток. Разработан метод получения преваскуляризированных клеточных сфероидов для использования в биопечати, параллельно с этим создана экспериментальная модель для оценки скорости ангиогенеза. Ведутся работы по оценке влияния низкоинтенсивного лазерного излучения на мезенхимальные стволовые клетки в контексте их терапевтических свойств. Накоплена обширная коллекция первичных клеточных культур.

Сотрудники лаборатории являются экспертами в области получения и выращивания клеточных культур различного происхождения, включая мезенхимные стволовые клетки, нейральные стволовые клетки, индуцированные плюрипотентные клетки, клетки эндотелия, кератиноциты, опухолевые клетки и др.. Применяются как обычные, так и 3D способы культивирования. В работе используются передовые инструментальные методы исследования использующие оборудование лаборатории, такие как: цитометрическая сортировка клеток в потоке (FACSAria III) и проточная цитометрия с визуализацией (ImageStreamX Mark II); флуоресцентная микроскопия с инновационной методикой программной очистки изображений Leica THUNDER, позволяющая получать псевдоконфокальное изображение, а также конфокальная микроскопия в ее «классическом» варианте (Zeiss 200); динамическое наблюдение за клеточными культурами с использованием IncuCyte Zoom; лазерная микродиссекция гистологических препаратов (Arcturus XT); ПЦР в режиме реального времени (Mx3005P Stratagene) и другие методы.

ПРОЕКТЫ

  • «Изучение иммунорегуляторных свойств первичных культур стволовых клеток мезенхимального и эктодермального происхождения» Госконтракт № 02.740.11.0297 (Агентство по науке и инновациям) Начало: 10 июля 2009 г. Окончание: 31 августа 2011 г. Цель работ — оценка экспрессии поверхностных маркеров и секреции цитокинов мезенхимальными стволовыми клетками и стволовыми клетками эктодермального происхождения для выяснения механизмов их иммунорегуляторных свойств.
  • «Разработка костных имплантатов нового поколения на основе нанокристаллического гидроксиапатита с использованием биомедицинских клеточных и лазерно-информационных технологий». Договор № 06/2009 от 01 июня 2009 г. с ОПЛТ ИПЛИТ РАН в рамках в рамках Г/К № 02.512.12.2041 (Агентство по науке и инновациям). Начало: 01 июня 2009. Окончание: 15 сентября 2010 г. Целью НИР является разработка на модельной системе метода лечения травм опорно-двигательной системы, костных дефектов с применением клеточных технологий: мезенхимальных стволовых клеток, биорезорбируемых костных имплантов.
  • «Изоляция и характеристика раковых стволовых клеток из солидных опухолей человека» Государственый контракт № П811 от 17 августа 2009 г, с Федеральноым агентством по образованию. Начало: 17 августа 2009. Окончание: 09 сентября 2011 г. Цель работы — изоляция раковых стволовых клеток из солидных опухолей человека, определение профиля их поверхностных маркеров и генной экспрессии для разработки новой мишени противораковой терапии.
  • «Получение и дифференциальное профилирование культур Т-регуляторных клеток человека, обладающих супрессорной активностью, индуцируемой раковыми или мезенхимальными стволовыми клетками» Г/К № 02.512.11.2063 (Агентство по науке и инновациям). Начало: 19 февраля 2007 г. Окончание: 31 октября 2007 г. Цель работ — разработка метода индуцированной дифференцировки и наращивания Т- регуляторных клеток в культуре, а также выявление уникальных маркёров Т- регуляторных клеток, для последующей разработки методов клеточной терапии онкологических и аутоиммунных заболеваний.
  • «Получение и адаптация культур мезенхимальных стволовых клеток и создание клеточных вакцин в целях коррекции травматических поражений центральной нервной системы». Госконтракт № 02.512.11.2095 (Агентство по науке и инновациям) Начало: 10 июля 2009 г. Окончание: 31 августа 2011 г. Цель работ — разработка на модельной системе метода лечения травм центральной нервной системы с применением клеточных технологий: активированных макрофагов, клеточных вакцин и мезенхимальных стволовых клеток.
  • «Протеомный анализ опухолей мезенхимального происхождения, различающихся по активности теломеразы». Проект РФФИ 07-04-01605-а. Методом поверхностного плазмонного резонанса, в оригинальной модификации, созданной при работе над данным проектом в 2008 г., измерена теломеразная активность в опухолях различного происхождения и теломеризованных нетрансформированных нейральных стволовых клетках. Кроме того, экспрессия теломеразы в этих клетках подтверждена методом количественной ПЦР (показана корреляция данных, полученных двумя указанными методами). Показано, что теломераза экспрессируется клетками как эпителиальных, так и соединительнотканных опухолей. Проведен протеомный анализ опухолей с различной экспрессией теломеразы.

НАУЧНО-ОБРАЗОВАТЕЛЬНЫЕ КУРСЫ

Курс лекций «Актуальные аспекты применения мезенхимальных стволовых клеток в регенеративной медицине». Курс включает лекционные занятия, описывающие место выделенных из различных источников МСК в структуре современной клеточной трансплантологии и тканевой инженерии с учетом возможных показаний и противопоказаний. Кроме того, курс охватывает правовые аспекты применения МСК в клинической практике.
avatar none Лекция 1. Актуальные вопросы разработки и применения клеточных технологий в практическом здравоохранении
avatar none Лекция 2. Требования к исходному материалу для создания клеточных технологий на основе МСК
avatar none Лекция 3. Возможности применения клеточной терапии для лечения ишемического инсульта
avatar none Лекция 4. Современные аспекты концепции раковых стволовых клеток
avatar none Лекция 5. Нанотехнологии в регенеративной медицине

Научно-методический материал «Методы выделения и культивирования мезенхимальных стволовых клеток». Материал содержит практические лабораторные занятия для ознакомления с базовыми принципами культивирования МСК.

НАУЧНО-ПОПУЛЯРНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Роль опухолевой стромы в прогрессировании рака. Материал посвящен описанию опухоль-стромальных взаимодействий в процессе опухолевой прогрессии и возможном участии в них МСК различного происхождения

avatar none  Ярыгина Н.К., Асатурова А.В., Ярыгин К.Н. (2021) Маточные рудименты: гистологическое и иммуногистохимическое исследование, Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 171(1), 106-114. DOI:10.47056/0365-9615-2021-171-1-106-114

avatar none  Гисина А.М., Ким Я.С., Ярыгин К.Н., Лупатов А.Ю. (2021) Выявление “боковой популяции”, ассоциированной с активностью ATP-зависимых транспортеров, при помощи проточной цитометрии с визуализацией, Биомедицинская химия, 67(2), 137-143. DOI:10.18097/PBMC20216702137

avatar none  Холоденко И.В., Ким Я.С., Гисина А.М., Лупатов А.Ю., Холоденко Р.В., Ярыгин К.Н. (2021) Исследование корреляции между экспрессией CD133 на клетках человеческой линии колоректальной аденокарциномы НТ-29 и их устойчивостью к химиотерапевтическим препаратам, Клеточные технологии в биологии и медицине, (1), 54-61. DOI:10.47056/1814-3490-2021-1-54-61

avatar none  Salikhova D., Bukharova T., Cherkashova E., Namestnikova D., Leonov G., Nikitina M., Gubskiy I., Akopyan G., Elchaninov A., Midiber K., Bulatenco N., Mokrousova V., Makarov A., Yarygin K., Chekhonin V., Mikhaleva L., Fatkhudinov T., Goldshtein D. (2021) Therapeutic Effects of hiPSC-Derived Glial and Neuronal Progenitor Cells-Conditioned Medium in Experimental Ischemic Stroke in Rats, International Journal of Molecular Sciences, 22(9), 4694. DOI:10.3390/ijms22094694

avatar none  Gisina A.M., Kim Y.S., Yarygin K.N., Lupatov A.Yu. (2021) Identification of the Side Population Associated with ATP-Binding Cassette Transporters Activity Using Imaging Flow Cytometry, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 15(3), 248-254. DOI:10.1134/S1990750821030033

avatar none  Krasnov G., Shkrigunov T., Radko S., Ptitsyn K., Shapovalova V., Timoshenko O., Khmeleva S., Kurbatov L., Kiseleva Y., Ilgisonis E., Kiseleva O., Vakhrushev I., Tsvetkova A., Buromski I., Markin S., Archakov A., Lisitsa A., Ponomarenko E. (2021) Human Chr18 transcriptome dataset combined from the Illumina HiSeq, ONT MinION, and qPCR data, Data in Brief, 36, 107130. DOI:10.1016/j.dib.2021.107130

avatar none  Дейниченко К.А., Краснов Г.С., Радько С.П., Птицын К.Г., Шаповалова В.В., Тимошенко О.С., Хмелева С.А., Курбатов Л.К., Киселева Я.Я., Ильгисонис Е.В., Пятницкий М.А., Поверенная Е.В., Киселева О.И., Вахрушев И.В., Цветкова А.В., Буромский И.В., Маркин С.С., Згода В.Г., Арчаков А.И., Лисица А.В., Пономаренко Е.А. (2021) Гены «стахановцы» 18 хромосомы человека, отсутствующие белки и не охарактеризованные белки в ткани печени и клеточной линии HepG2, Biomedical Chemistry: Research and Methods, 4(1), e00144. DOI:10.18097/BMCRM00144

avatar none  Namestnikova D.D., Gubskiy I.L., Revkova V.A., Sukhinich K.K., Melnikov P.A., Gabashvili A.N., Cherkashova E.A., Vishnevskiy D.A., Kurilo V.V., Burunova V.V., Semkina A.S., Abakumov M.A., Gubsky L.V., Chekhonin V.P., Ahlfors J.-E., Baklaushev V.P., Yarygin K.N. (2021) Intra-Arterial Stem Cell Transplantation in Experimental Stroke in Rats: Real-Time MR Visualization of Transplanted Cells Starting With Their First Pass Through the Brain With Regard to the Therapeutic Action, Frontiers in Neuroscience, 15, 641970. DOI:10.3389/fnins.2021.641970

avatar none  Novikova S., Tikhonova O., Kurbatov L., Farafonova T., Vakhrushev I., Lupatov A., Yarygin K., Zgoda V. (2021) Omics Technologies to Decipher Regulatory Networks in Granulocytic Cell Differentiation, Biomolecules, 11(6), 907. DOI:10.3390/biom11060907

avatar none  Gisina A., Novikova S., Kim Y., Sidorov D., Bykasov S., Volchenko N., Kaprin A., Zgoda V., Yarygin K., Lupatov A. (2021) CEACAM5 overexpression is a reliable characteristic of CD133-positive colorectal cancer stem cells, Cancer Biomarkers, 32(1), 85-98. DOI:10.3233/CBM-203187