Лаборатория межмолекулярных взаимодействий

• Биосенсорные технологии: оптические биосенсоры на эффекте поверхностного плазмонного резонанса (SPR), разработка методологии регенерации оптических чипов и новых принципов иммобилизации лигандов.
• Исследования в рамках государственного задания 122030100168-2 «Разработка экспериментальных методов исследования белкового интерактома, анализ белок-белковых и белок-лигандных взаимодействий, поиск регуляторов функционирования целевых белков и белок-белковых взаимодействий»
• Протеомные исследования в рамках научной программы биологического спутника БИОН-М №2.
• Выполнение заказных НИР (в рамках услуг ЦКП) по теме «Биосенсорный SPR анализ взаимодействий низкомолекулярных соединений морского происхождения с целевыми белками-ферментами» (заказчик - ТИБОХ ДВО РАН по гранту РНФ № 23-44-10009, 2023-2025).
• Выполнение заказных НИР (в рамках работы ЦКП «Протеом человека») для коммерческих и академических заказчиков с использованием технологий биосенсорного SPR анализа, молекулярного фишинга, анализа иммуногенности лекарств и скрининга биологически активных веществ по их взаимодействию с целевыми белками-мишенями.

  Tumilovich A., Yablokov E., Mezentsev Yu., Ershov P., Basina V., Gnedenko O., Kaluzhskiy L., Tsybruk T., Grabovec I., Kisel M., Shabunya P., Soloveva N., Vavilov N., Gilep A., Ivanov A. (2024) The Multienzyme Complex Nature of Dehydroepiandrosterone Sulfate Biosynthesis, International Journal of Molecular Sciences, 25(4), 2072. DOI:10.3390/ijms25042072

  Vasileva E.A., Berdyshev D.V., Mishchenko N.P., Gerasimenko A.V., Menchinskaya E.S., Pislyagin E.A., Chingizova E.A., Kaluzhskiy L.A., Dautov S.S., Fedoreyev S.A. (2024) Phanogracilins A–C, New Bibenzochromenones of Crinoid Phanogenia gracilis (Hartlaub, 1890), Biomolecules, 14(2), 151. DOI:10.3390/biom14020151

  Kaluzhskiy L., Yablokov E., Gnedenko O., Burkatovskii D., Maslov I., Bogorodskiy A., Ershov P., Tsybruk T., Zelepuga E., Rutckova T., Kozlovskaya E., Dmitrenok P., Gilep A., Borshchevskiy V., Strushkevich N., Ivanov A. (2024) The effect of membrane composition on the interaction between human CYP51 and its flavonoid inhibitor - luteolin 7,3′-disulfate, Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes, 1866(3), 184286. DOI:10.1016/j.bbamem.2024.184286

  Pislyagin E.A., Menchinskaya E.S., Gladkikh I.N., Kvetkina A.N., Sintsova O.V., Popkova D.V., Kozlovskiy S.A., Gorpenchenko T.Y., Likhatskaya G.N., Kaluzhskiy L.A., Ivanov A.S., Andreev Y.A., Kozlov S.A., Dmitrenok P.S., Aminin D.L., Leychenko E.V. (2023) Recombinant Analogs of Sea Anemone Kunitz-Type Peptides Influence P2X7 Receptor Activity in Neuro-2a Cells, Marine Drugs, 21(3), 192. DOI:10.3390/md21030192

  Gilep A., Kuzikov A., Sushko T., Grabovec I., Masamrekh R., Sigolaeva L.V., Pergushov D.V., Schacher F.H., Strushkevich N., Shumyantseva V.V. (2022) Electrochemical characterization of mutant forms of rubredoxin B from Mycobacterium tuberculosis, Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 1870(1), 140734. DOI:10.1016/j.bbapap.2021.140734

  Ershov P.V., Mezentsev Y.V., Ivanov A.S. (2022) Interfacial Peptides as Affinity Modulating Agents of Protein-Protein Interactions, Biomolecules, 12(1), 106. DOI:10.3390/biom12010106

  Rodriguez-Antona C., Savieo J.L., Lauschke V.M., Sangkuhl K., Drögemöller B.I., Wang D., van Schaik R.H.N., Gilep A.A., Peter A.P., Boone E.C., Ramey B.E., Klein T.E., Whirl-Carrillo M., Pratt V.M., Gaedigk A. (2022) PharmVar GeneFocus: CYP3A5, Clinical Pharmacology & Therapeutics, 112(6), 1159-1171. DOI:10.1002/cpt.2563

  Varaksa T., Bukhdruker S., Grabovec I., Marin E., Kavaleuski A., Gusach A., Kovalev K., Maslov I., Luginina A., Zabelskii D., Astashkin R., Shevtsov M., Smolskaya S., Kavaleuskaya A., Shabunya P., Baranovsky A., Dolgopalets V., Charnou Y., Savachka A., Litvinovskaya R., Hurski A., Shevchenko E., Rogachev A., Mishin A., Gordeliy V., Gabrielian A., Hurt D.E., Nikonenko B., Majorov K., Apt A., Rosenthal A., Gilep A., Borshchevskiy V., Strushkevich N. (2021) Metabolic Fate of Human Immunoactive Sterols in Mycobacterium tuberculosis, Journal of Molecular Biology, 433(4), 166763. DOI:10.1016/j.jmb.2020.166763

  Yablokov E.O., Sushko T.A., Kaluzhskiy L.A., Kavaleuski A.A., Mezentsev Y.V., Ershov P.V., Gilep A.A., Ivanov А.S., Strushkevich N.V. (2021) Substrate-induced modulation of protein-protein interactions within human mitochondrial cytochrome P450-dependent system, Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, 208, 105793. DOI:10.1016/j.jsbmb.2020.105793

  Sushko T., Kavaleuski A., Grabovec I., Kavaleuskaya A., Vakhrameev D., Bukhdruker S., Marin E., Kuzikov A., Masamrekh R., Shumyantseva V., Tsumoto K., Borshchevskiy V., Gilep A., Strushkevich N. (2021) A new twist of rubredoxin function in M. Tuberculosis, Bioorganic Chemistry, 109, 104721. DOI:10.1016/j.bioorg.2021.104721

  Ershov P.V., Yablokov Е.O., Florinskaya A.V., Mezentsev Y.V., Kaluzhskiy L.А., Tumilovich A.M., Gilep А.А., Usanov S.A., Ivanov АS. (2019) SPR—Based study of affinity of cytochrome P450s / redox partners interactions modulated by steroidal substrates, Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, 187, 124-129. DOI:10.1016/j.jsbmb.2018.11.009

  Meza-Menchaca T., Ramos-Ligonio A., López-Monteon A., Vidal Limón A., Kaluzhskiy L.A., V Shkel T., V Strushkevich N., Jiménez-García L.F., Agredano Moreno L.T., Gallegos-García V., Suárez-Medellín J., Trigos Á. (2019) Insights into Ergosterol Peroxide`s Trypanocidal Activity, Biomolecules, 9(9), 484. DOI:10.3390/biom9090484