Лаборатория межмолекулярных взаимодействий

• Биосенсорные технологии: оптические биосенсоры на эффекте поверхностного плазмонного резонанса (SPR), разработка методологии регенерации оптических чипов и новых принципов иммобилизации лигандов.
• Исследования в рамках государственного задания 122030100168-2 «Разработка экспериментальных методов исследования белкового интерактома, анализ белок-белковых и белок-лигандных взаимодействий, поиск регуляторов функционирования целевых белков и белок-белковых взаимодействий»
• Протеомные исследования в рамках научной программы биологического спутника БИОН-М №2.
• Выполнение заказных НИР (в рамках услуг ЦКП) по теме «Биосенсорный SPR анализ взаимодействия вторичных метаболитов морских грибов с рецепторами эстрогена» (заказчик - ТИБОХ ДВО РАН по гранту РНФ № 25-73-20049, 2025-2027).
• Выполнение заказных НИР (в рамках работы ЦКП «Протеом человека») для коммерческих и академических заказчиков с использованием технологий биосенсорного SPR анализа, молекулярного фишинга, анализа иммуногенности лекарств и скрининга биологически активных веществ по их взаимодействию с целевыми белками-мишенями.

  Kaluzhskiy L., Yablokov E., Varaksa T., Grudo A., Karputs A., Grabovec I., Mezentsev Y., Zelepuga E., Gnedenko O., Tolkanov D., Malyarenko T., Kolesnikova S., Kozhushnaya A., Vasileva E., Mishchenko N., Silchenko A., Avilov S., Rutckova T., Tarbeeva D., Kalinin V., Kicha A., Kozlovskaya E., Fedoreyev S., Ivanchina N., Dmitrenok P., Gilep A., Ivanov A. (2026) Diverse ligands for mycobacterial CYP124 identified from plant and marine compounds, Biochimie, 245, 40-54. DOI:10.1016/j.biochi.2026.02.019

  Ершов П.В., Яблоков Е.О., Калужский Л.А., Мезенцев Ю.В., Гнеденко О.В., Константинов М.А., Торопыгин И.Ю., Иванов А.С. (2025) Глицирризиновая кислота: новые потенциальные белковые мишени, Биомедицинская химия, 71(4), 270-282. DOI:10.18097/PBMCR1595

  Konstantinov M., Kaluzhskiy L., Yablokov E., Zhdanov D., Ivanov A., Toropygin I. (2025) Substrate Specificity and Peptide Motif Preferences of β-Lytic and L5 Proteases from Lysobacter spp. Revealed by LC–MS/MS Analysis, International Journal of Molecular Sciences, 26(17), 8603. DOI:10.3390/ijms26178603

  Tumilovich A., Yablokov E., Mezentsev Yu., Ershov P., Basina V., Gnedenko O., Kaluzhskiy L., Tsybruk T., Grabovec I., Kisel M., Shabunya P., Soloveva N., Vavilov N., Gilep A., Ivanov A. (2024) The Multienzyme Complex Nature of Dehydroepiandrosterone Sulfate Biosynthesis, International Journal of Molecular Sciences, 25(4), 2072. DOI:10.3390/ijms25042072

  Kaluzhskiy L., Yablokov E., Gnedenko O., Burkatovskii D., Maslov I., Bogorodskiy A., Ershov P., Tsybruk T., Zelepuga E., Rutckova T., Kozlovskaya E., Dmitrenok P., Gilep A., Borshchevskiy V., Strushkevich N., Ivanov A. (2024) The effect of membrane composition on the interaction between human CYP51 and its flavonoid inhibitor - luteolin 7,3′-disulfate, Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes, 1866(3), 184286. DOI:10.1016/j.bbamem.2024.184286

  Gilep A., Varaksa T., Bukhdruker S., Kavaleuski A., Ryzhykau Y., Smolskaya S., Sushko T., Tsumoto K., Grabovec I., Kapranov I., Okhrimenko I., Marin E., Shevtsov M., Mishin A., Kovalev K., Kuklin A., Gordeliy V., Kaluzhskiy L., Gnedenko O., Yablokov E., Ivanov A., Borshchevskiy V., Strushkevich N. (2023) Structural insights into 3Fe–4S ferredoxins diversity in M. tuberculosis highlighted by a first redox complex with P450, Frontiers in Molecular Biosciences, 9, 1100032. DOI:10.3389/fmolb.2022.1100032

  Ершов П.В., Яблоков Е.О., Мезенцев Ю.В., Чуев Г.Н., Федотова М.В., Кручинин С.Е., Иванов А.С. (2022) Папаиноподобная протеаза PLpro коронавируса SARS-COV-2 как противовирусная мишень для ингибиторов активного центра и белок-белковых взаимодействий, Биофизика, 67(6), 1109-1121. DOI:10.31857/S0006302922060084

  Kaluzhskiy L., Ershov P., Yablokov E., Shkel T., Grabovec I., Mezentsev Yu., Gnedenko O., Usanov S., Shabunya P., Fatykhava S., Popov A., Artyukov A., Styshova O., Gilep A., Strushkevich N., Ivanov A. (2021) Human Lanosterol 14-Alpha Demethylase (CYP51A1) Is a Putative Target for Natural Flavonoid Luteolin 7,3′-Disulfate, Molecules, 26(8), 2237. DOI:10.3390/molecules26082237

  Ershov P., Kaluzhskiy L., Mezentsev Yu., Yablokov E., Gnedenko O., Ivanov A. (2021) Enzymes in the Cholesterol Synthesis Pathway: Interactomics in the Cancer Context, Biomedicines, 9(8), 895. DOI:10.3390/biomedicines9080895

  Ershov P.V., Mezentsev Yu.V., Kopylov A.T., Yablokov E.O., Svirid A.V., Lushchyk A.Ya., Kaluzhskiy L.A., Gilep A.A., Usanov S.A., Medvedev A.E., Ivanov A.S. (2019) Affinity Isolation and Mass Spectrometry Identification of Prostacyclin Synthase (PTGIS) Subinteractome, Biology, 8(2), 49. DOI:10.3390/biology8020049