XXIX Симпозиум по биоинформатике и компьютерному конструированию лекарств

Целью XXIX Симпозиума «Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» является представление наиболее важных достижений в разработке и практическом применении компьютерных методов поиска и валидации новых мишеней действия лекарств, конструирования in silico более эффективных и безопасных фармакологических веществ, оптимизации структуры и свойств лекарственных соединений, рациональных подходов к применению терапевтических средств в медицинской практике, а также обсуждение перспектив развития этой мультидисциплинарной области.

Основным лейтмотивом Симпозиума стало обсуждение новых «вызовов» и возможностей в области поиска новых лекарственных препаратов с применением методов in silico. Как показывает практика борьбы с социально значимыми заболеваниями последних лет и, особенно, COVID-19, огромную роль в разработке физиологически активных соединений играет применение мультидисциплинарных подходов биоинформатики и компьютерных технологий в целом. Эти методы позволяют обрабатывать огромные массивы биомедицинских данных in silico, идентифицировать перспективные молекулярные мишени, выявлять количественные взаимосвязи «структура-активность», строить и валидировать прогностические модели, осуществлять рациональный молекулярный дизайн соединений-лидеров, и предоставлять обоснованные рекомендации медицинским химикам, фармакологам, токсикологам, врачам и регистрационным органам по оптимизации разработки, тестирования и применения лекарств.

Для участия в Симпозиуме зарегистрировалось 497 человек, представляющих университеты (77%), научно-исследовательские институты (18%), высокотехнологические компании (4%), медицинские и регуляторные организации (1%), а также отдельных исследователей, аспирантов и студентов из 52 стран мира.

Научная программа мероприятий представлена на веб-сайте Симпозиума. На Симпозиуме было представлено 13 пленарных, 8 ключевых и 25 устных докладов, а также 18 кратких сообщений в рамках Конкурса молодых ученых, которые были отобраны членами Международного научного комитета на основе рассмотрения 66 поступивших тезисов докладов.

В числе докладчиков были как известные специалисты, в течение многих лет активно работающие в области компьютерного конструирования лекарств, так и молодые ученые, аспиранты и студенты из Бразилии, Белоруссии, Германии, Грузии, Израиля, Индии, Индонезии, Ирландии, Мексики, Нидерландов, Пакистана, России, США, Филиппин, Швеции. Многие научные сообщения вызвали живой интерес у участников Симпозиума: всего было задано около 280 вопросов, на которые в онлайн режиме были получены ответы и представлены комментарии.

В рамках Симпозиума проведен конкурс докладов молодых ученых: было подано 66 заявок, 18 докладов отобрано Международным научным комитетом для кратких устных сообщений; семь победителей из Бразилии, Мексики, России и Белоруссии награждены почетными дипломами.

Диплом первой степени был присужден Ивану Кузнецову, аспиранту Московского финансово-юридического университета (Россия) за доклад «EDGAR - a deep learning-based program for prediction of folding energy of nucleic acids».

Дипломов второй степени были удостоены Руслан Маллаев, техник-лаборант Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова (Россия) за доклад «ARTEMIS - studying the communication of biomolecules using information theory» и Luis Melo, студент Federal University of Paraiba (Бразилия) за доклад «Development of a standardized approach for transfer learning with QSAR models».

Дипломами третьей степени были награждены Juan Felipe Avellaneda-Tamayo, студент магистратуры Universidad Nacional Autónoma de México (Мексика) за доклад «Chemical multiverse and diversity of food chemicals», Антон Колодницкий, студент Института биомедицинской химии (Россия) за доклад «A comprehensive database for predicting metabolism of xenobiotics by human microbiome», Анна Карпенко, аспирантка Объединённого института проблем информатики Национальной академии наук Беларуси (Белоруссия) за доклад «Generative hetero-encoder model for de novo design of small-molecule compounds as potential inhibitors of BCR-ABL tyrosine kinase» и Дарья Фролова, студентка магистратуры Сколковского института науки и технологий (Россия) за доклад «StructPLM - enhancing protein representations with structural information».

Подготовлен сборник Материалов Симпозиума «Proceedings Book of the XXIX Symposium "Bioinformatics and Computer-Aided Drug Discovery"», М.: Институт биомедицинской химии, 2023. – 158 С. Сборник зарегистрирован в РИНЦ, ISBN 978-5-900760-19-3, DOI: 10.18097/BCADD2023. Многие из опубликованных в сборнике тезисов докладов содержат благодарности на грантовую поддержку, включая гранты Министерства науки и высшего образования – 5 тезисов, Российского научного фонда – 21 тезис, Государственной программы научных исследований Беларуси – 4 тезиса и Белорусского фонда фундаментальных исследований – 2 тезиса.

Современные подходы к поиску и созданию новых лекарственных препаратов базируются на мультидисциплинарных исследованиях. Применение технологий in silico на всех стадиях разработки существенно снижает временные и финансовые затраты и повышает шансы на получение более безопасных и эффективных лекарств. Эта проблематика соответствует двум приоритетным направлениям Стратегии научно-технологического развития Российской Федерации: пункт 20 подпункт «в» переход к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и пункт 20 подпункт «а» переход к передовым цифровым, интеллектуальным производственным технологиям, роботизированным системам, новым материалам и способам конструирования, создание систем обработки больших объемов данных, машинного обучения и искусственного интеллекта.

Проведение XXIX Симпозиума «Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» в формате международного мероприятия обеспечивает:
- повышение уровня информационного обмена как внутри научного сообщества, так и между организациями сектора исследований и разработок в области наук о жизни, коммерческого сектора в лице фармацевтических и биотехнологических компаний, высшего профессионального образования, включая молодых ученых и студентов;
- расширение способов и инструментов научного взаимодействия и обмена информацией в области медицины и таких междисциплинарных направлений как биоинформатика, хемоинформатика и системная биология;
- обсуждение стратегии, политики и передового опыта в области разработки и применения компьютерных методов для создания новых лекарств, включая практические применения в смежных областях биомедицины;
- возможность участникам обменяться информацией о последних достижениях в области хемо- и биоинформатики, системной биологии и медицины, связанным с разработкой и практическим применением компьютерных методов для создания более безопасных и эффективных лекарств, а также в смежных областях биомедицины;
- расширение возможности обмена знаниями и опытом российских и иностранных ученых, профессоров и преподавателей, аспирантов и студентов в рамках конкурса работ молодых ученых.